Tuning Plant Promoters Using a Simple Split Luciferase Method to Assess Transcription Factor-DNA Interactions.
Tuning Plant Promoters Using a Simple Split Luciferase Method to Assess Transcription Factor-DNA Interactions.
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DOI：
10.1021/acssynbio.3c00094
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发表时间：
2023-11-17
影响因子：
4.7
通讯作者：
Patron, N. J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cai, Y. -M;Witham, S.;Patron, N. J.
序列特征，包括结合基序对其同源转录因子的亲和力，是启动子行为的重要贡献者。可预测地重新编码亲和力的能力使得能够开发对已知细胞信号具有不同水平响应的合成启动子。在这里，我们描述了一种基于发光的微孔板测定比较短的DNA探针与转录因子的相互作用。然后，我们展示了如何使用这些数据来设计不同的强度，响应相同的转录因子的合成植物启动子。
Sequence features, including the affinity of binding motifs for their cognate transcription factors, are important contributors to promoter behavior. The ability to predictably recode affinity enables the development of synthetic promoters with varying levels of response to known cellular signals. Here we describe a luminescence-based microplate assay for comparing the interactions of transcription factors with short DNA probes. We then demonstrate how these data can be used to design synthetic plant promoters of varying strengths that respond to the same transcription factor.
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影响因子：
14.9
作者：
LAM, E;LAM, YKP
通讯作者：
LAM, YKP
植物蛋白的生物基础辅助表达和表征。
DOI：
10.1093/synbio/ysab029
发表时间：
2021
期刊：
Synthetic biology (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Dudley QM;Cai YM;Kallam K;Debreyne H;Carrasco Lopez JA;Patron NJ
通讯作者：
Patron NJ
影响因子：
14.9
作者：
Bailey TL;Johnson J;Grant CE;Noble WS
通讯作者：
Noble WS
影响因子：
7.7
作者：
Allu, Annapurna Devi;Brotman, Yariv;Balazadeh, Salma
通讯作者：
Balazadeh, Salma
影响因子：
14.9
作者：
Cai YM;Kallam K;Tidd H;Gendarini G;Salzman A;Patron NJ
通讯作者：
Patron NJ