The ins and outs of algal metal transport.
The ins and outs of algal metal transport.
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DOI：
10.1016/j.bbamcr.2012.04.010
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发表时间：
2012-09
影响因子：
5.1
通讯作者：
Merchant, Sabeeha S.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Blaby-Haas, Crysten E.;Merchant, Sabeeha S.
金属转运蛋白是藻类与环境相互作用的重要组成部分。它们代表了金属浓度细胞扰动的第一道防线，通过分析藻类金属转运蛋白库，我们可以深入了解藻类生物学的一个基本方面。个体藻类在具有独特地球化学的环境中茁壮成长的能力，与通常用作金属稳态参考生物的非藻类物种相比，提供了一个机会来扩大我们对生物金属需求，偏好和贩运的理解。莱茵衣藻是藻类生物学研究中最发达的参考生物，特别是在金属代谢方面;然而，藻类生态位的多样性需要对所有已测序的藻类基因组进行比较基因组分析。使用蛋白质相似性网络对动物、植物、真菌和藻类中已知和推定的蛋白质进行比较，揭示了衣原体中存在新的金属代谢组分，包括新的铁和铜转运蛋白。这种分析也支持的概念，在金属代谢方面，藻类从类似的生态位是更多的相关彼此比藻类从相同的系统发育支。
Metal transporters are a central component in the interaction of algae with their environment. They represent the first line of defense to cellular perturbations in metal concentration, and by analyzing algal metal transporter repertoires, we gain insight into a fundamental aspect of algal biology. The ability of individual algae to thrive in environments with unique geochemistry, compared to non-algal species commonly used as reference organisms for metal homeostasis, provides an opportunity to broaden our understanding of biological metal requirements, preferences and trafficking. Chlamydomonas reinhardtii is the best developed reference organism for the study of algal biology, especially with respect to metal metabolism; however, the diversity of algal niches necessitates a comparative genomic analysis of all sequenced algal genomes. A comparison between known and putative proteins in animals, plants, fungi and algae using protein similarity networks has revealed the presence of novel metal metabolism components in Chlamydomonas including new iron and copper transporters. This analysis also supports the concept that, in terms of metal metabolism, algae from similar niches are more related to one another than to algae from the same phylogenetic clade.
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