Diverse Long RNAs Are Differentially Sorted into Extracellular Vesicles Secreted by Colorectal Cancer Cells.
Diverse Long RNAs Are Differentially Sorted into Extracellular Vesicles Secreted by Colorectal Cancer Cells.
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DOI：
10.1016/j.celrep.2018.09.054
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发表时间：
2018-10-16
期刊：
影响因子：
8.8
通讯作者：
Patton JG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hinger SA;Cha DJ;Franklin JL;Higginbotham JN;Dou Y;Ping J;Shu L;Prasad N;Levy S;Zhang B;Liu Q;Weaver AM;Coffey RJ;Patton JG
分泌的编码和长非编码RNA（lncRNA; >200 nt）的调节和功能作用在很大程度上是未知的。我们先前表明，突变KRAS结直肠癌（CRC）细胞释放细胞外囊泡（EV）含有不同的蛋白质组，microRNA（miRNA）和环状RNA。在这里，我们全面鉴定了EV中分泌的CRC细胞外长RNA的不同类别，并证明了特异性RNA的差异输出。不同的非编码RNA，包括反义转录本和来自假基因的转录本，与细胞谱相比，在EV中富集。我们检测到突变KRAS EV中Rab 13的强烈富集，并证明Rab 13 mRNA向受体细胞的功能性递送。为了测定lncRNA的功能转移，我们实施了基于CRISPR/ Cas9的RNA跟踪系统来监测向受体细胞的递送。我们表明，含有来自分泌RNA的输出信号的gRNA可以从供体细胞转移到受体细胞。我们的数据支持细胞机制的存在，以选择性地出口不同类别的RNA。细胞外囊泡（EV）含有可以在细胞之间转移的蛋白质和RNA货物。Hinger等人鉴定了细胞编码和长非编码RNA的不同子集，这些RNA富集在可以在细胞之间功能性转移的EV中，支持细胞-细胞通信的调节形式。
The regulation and functional roles of secreted coding and long noncoding RNAs (lncRNAs; >200 nt) are largely unknown. We previously showed that mutant KRAS colorectal cancer (CRC) cells release extracellular vesicles (EVs) containing distinct proteomes, microRNAs (miRNAs), and circular RNAs. Here, we comprehensively identify diverse classes of CRC extracellular long RNAs secreted in EVs and demonstrate differential export of specific RNAs. Distinct noncoding RNAs, including antisense transcripts and transcripts derived from pseudogenes, are enriched in EVs compared to cellular profiles. We detected strong enrichment of Rab13 in mutant KRAS EVs and demonstrate functional delivery of Rab13 mRNA to recipient cells. To assay functional transfer of lncRNAs, we implemented a CRISPR/ Cas9-based RNA-tracking system to monitor delivery to recipient cells. We show that gRNAs containing export signals from secreted RNAs can be transferred from donor to recipient cells. Our data support the existence of cellular mechanisms to selectively export diverse classes of RNA. Extracellular vesicles (EVs) contain protein and RNA cargo that can be transferred between cells. Hinger et al. identify distinct subsets of cellular coding and long noncoding RNAs that are enriched in EVs that can be functionally transferred between cells, supporting a regulated form of cell-cell communication.
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影响因子：
16
作者：
Mateescu B;Kowal EJ;van Balkom BW;Bartel S;Bhattacharyya SN;Buzás EI;Buck AH;de Candia P;Chow FW;Das S;Driedonks TA;Fernández-Messina L;Haderk F;Hill AF;Jones JC;Van Keuren-Jensen KR;Lai CP;Lässer C;Liegro ID;Lunavat TR;Lorenowicz MJ;Maas SL;Mäger I;Mittelbrunn M;Momma S;Mukherjee K;Nawaz M;Pegtel DM;Pfaffl MW;Schiffelers RM;Tahara H;Théry C;Tosar JP;Wauben MH;Witwer KW;Nolte-'t Hoen EN
通讯作者：
Nolte-'t Hoen EN
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作者：
Fritz JV;Heintz-Buschart A;Ghosal A;Wampach L;Etheridge A;Galas D;Wilmes P
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Wilmes P
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作者：
Kim HS;Kim SC;Kim SJ;Park CH;Jeung HC;Kim YB;Ahn JB;Chung HC;Rha SY
通讯作者：
Rha SY
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作者：
Freedman JE;Gerstein M;Mick E;Rozowsky J;Levy D;Kitchen R;Das S;Shah R;Danielson K;Beaulieu L;Navarro FC;Wang Y;Galeev TR;Holman A;Kwong RY;Murthy V;Tanriverdi SE;Koupenova-Zamor M;Mikhalev E;Tanriverdi K
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Tanriverdi K
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作者：
Becker A;Thakur BK;Weiss JM;Kim HS;Peinado H;Lyden D
通讯作者：
Lyden D