Influenza A virus coding regions exhibit host-specific global ordered RNA structure.
Influenza A virus coding regions exhibit host-specific global ordered RNA structure.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0035989
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Turner DH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Priore SF;Moss WN;Turner DH
甲型流感是一个重大的公共卫生威胁，部分原因是它能够很容易地在不同宿主物种之间交换基因片段，形成新的大流行毒株。了解造成不同流感宿主之间物种障碍的基本因素将有助于识别能够导致大流行爆发的菌株，并可能为疫苗的开发提供信息。在这里，我们描述了预测的RNA二级结构稳定性在禽类、猪和人类编码区之间存在的差异。结果表明，甲型流感病毒片段1、5、7和8中存在全局有序的RNA结构，不同宿主株形成二级结构的自由能范围不同。来自禽类、猪类和人类的毒株的预测自由能分布为片段重新分类提供了标准，并且毒株可能是病毒减毒和疫苗开发的理想候选者。
Influenza A is a significant public health threat, partially because of its capacity to readily exchange gene segments between different host species to form novel pandemic strains. An understanding of the fundamental factors providing species barriers between different influenza hosts would facilitate identification of strains capable of leading to pandemic outbreaks and could also inform vaccine development. Here, we describe the difference in predicted RNA secondary structure stability that exists between avian, swine and human coding regions. The results predict that global ordered RNA structure exists in influenza A segments 1, 5, 7 and 8, and that ranges of free energies for secondary structure formation differ between host strains. The predicted free energy distributions for strains from avian, swine, and human species suggest criteria for segment reassortment and strains that might be ideal candidates for viral attenuation and vaccine development.
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影响因子：
5.8
作者：
Gultyaev, Alexander P.;Heus, Hans A.;Olsthoorn, Rene C. L.
通讯作者：
Olsthoorn, Rene C. L.
影响因子：
1.8
作者：
HOFACKER, IL;FONTANA, W;SCHUSTER, P
通讯作者：
SCHUSTER, P
DOI：
10.1007/978-3-0346-0279-2_11
发表时间：
2011-01-01
期刊：
INFLUENZA VACCINES FOR THE FUTURE, SECOND EDITION
影响因子：
--
作者：
Greenberg, Harry;Kemble, George
通讯作者：
Kemble, George
影响因子：
30.3
作者：
Taubenberger JK;Kash JC
通讯作者：
Kash JC
影响因子：
82.9
作者：
Chen, WS;Calvo, PA;Yewdell, JW
通讯作者：
Yewdell, JW