Coordinating dissent as an alternative to consensus classification: insights from systematics for bio-ontologies
Coordinating dissent as an alternative to consensus classification: insights from systematics for bio-ontologies
复制标题
协调异议作为共识分类的替代方案：生物本体系统学的见解
DOI：
10.1007/s40656-020-0300-z
复制
发表时间：
2020
影响因子：
2
通讯作者：
Franz, Nico
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sterner, Beckett;Witteveen, Joeri;Franz, Nico
收集数据并将其分类为有意义的类别是知识形成过程中的关键步骤。在生命科学领域，数据发现和整合工具的设计一直依赖于这样一个前提，即用于表达一系列数据的正式分类系统应以共识的分类定义为基础。在这种方法上，以开放生物医学本体论铸造厂的现实主义计划为例，通过将数据的表示和聚合建立在既定知识的基础上，使进展最大化。我们认为，系统生物学的历史实践提供了一个重要的和被忽视的替代方法来分类和传播数据，基于协调的原则，而不是定义的共识。系统学家已经开发了一个强大的系统来引用分类实体，可以提供高质量的数据发现和整合，而无需调用关于现实或“固定”科学的共识。
The collection and classification of data into meaningful categories is a key step in the process of knowledge making. In the life sciences, the design of data discovery and integration tools has relied on the premise that a formal classificatory system for expressing a body of data should be grounded in consensus definitions for classifications. On this approach, exemplified by the realist program of the Open Biomedical Ontologies Foundry, progress is maximized by grounding the representation and aggregation of data on settled knowledge. We argue that historical practices in systematic biology provide an important and overlooked alternative approach to classifying and disseminating data, based on a principle of coordinative rather than definitional consensus. Systematists have developed a robust system for referring to taxonomic entities that can deliver high quality data discovery and integration without invoking consensus about reality or “settled” science.
登录
查看更多内容
通用医学语言系统和基因本体论：一些批判性的思考
DOI：
--
发表时间：
2003
期刊：
Deutsche Jahrestagung für Künstliche Intelligenz
影响因子：
--
作者：
Anand Kumar;Barry Smith
通讯作者：
Barry Smith
影响因子：
1.3
作者：
Remsen D
通讯作者：
Remsen D
DOI：
10.1093/database/bas057
发表时间：
2013
期刊：
Database : the journal of biological databases and curation
影响因子：
--
作者：
Bertone MA;Mikó I;Yoder MJ;Seltmann KC;Balhoff JP;Deans AR
通讯作者：
Deans AR
影响因子：
1.3
作者：
Lepage D;Vaidya G;Guralnick R
通讯作者：
Guralnick R
命名法、术语和语言
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
M. Epstein
通讯作者：
M. Epstein