Matching arthropod anatomy ontologies to the Hymenoptera Anatomy Ontology: results from a manual alignment.
Matching arthropod anatomy ontologies to the Hymenoptera Anatomy Ontology: results from a manual alignment.
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DOI：
10.1093/database/bas057
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发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Deans AR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bertone MA;Mikó I;Yoder MJ;Seltmann KC;Balhoff JP;Deans AR
匹配是提高异构本体间互操作性的重要步骤。在这里，我们提出的路线，我们生产的领域专家，使用手动映射过程中，Hyattera解剖本体和其他现有的节肢动物解剖本体（代表蜘蛛，蜱，蚊子和果蝇）之间。所得到的比对包含从43到368个映射（对应），所有来自领域专家的输入。尽管有许多成对的对应关系，只有11个对应关系被发现在所有本体之间是共同的，这表明每个本体之间的主要内在差异或代表每个组的解剖结构的差距。此外，我们将我们的发现与Bioportal（源自LOOM软件）的推定对应进行比较，并以全面证据对齐的方式总结结果。我们简要地讨论了本体的特点和匹配过程中的问题。数据库URL：http://purl.obolibrary.org/obo/hao/2012-07-18/arthropod-mappings.obo
Matching is an important step for increasing interoperability between heterogeneous ontologies. Here, we present alignments we produced as domain experts, using a manual mapping process, between the Hymenoptera Anatomy Ontology and other existing arthropod anatomy ontologies (representing spiders, ticks, mosquitoes and Drosophila melanogaster). The resulting alignments contain from 43 to 368 mappings (correspondences), all derived from domain-expert input. Despite the many pairwise correspondences, only 11 correspondences were found in common between all ontologies, suggesting either major intrinsic differences between each ontology or gaps in representing each group’s anatomy. Furthermore, we compare our findings with putative correspondences from Bioportal (derived from LOOM software) and summarize the results in a total evidence alignment. We briefly discuss characteristics of the ontologies and issues with the matching process. Database URL: http://purl.obolibrary.org/obo/hao/2012-07-18/arthropod-mappings.obo
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影响因子：
46.9
作者：
Smith, Barry;Ashburner, Michael;Lewis, Suzanna
通讯作者：
Lewis, Suzanna
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作者：
Topalis, P.;Tzavlaki, C.;Louis, C.
通讯作者：
Louis, C.
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1.3
作者：
Seltmann, Katja C.;Yoder, Matthew J.;Deans, Andrew R.
通讯作者：
Deans, Andrew R.
DOI：
10.1093/database/bar066
发表时间：
2012-03-20
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5.8
作者：
Hayamizu, Terry F.;de Coronado, Sherri;Ringwald, Martin
通讯作者：
Ringwald, Martin
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作者：
Mungall CJ;Torniai C;Gkoutos GV;Lewis SE;Haendel MA
通讯作者：
Haendel MA