Glia-specific enhancers and chromatin structure regulate NFIA expression and glioma tumorigenesis.
Glia-specific enhancers and chromatin structure regulate NFIA expression and glioma tumorigenesis.
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DOI：
10.1038/nn.4638
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发表时间：
2017-11
影响因子：
25
通讯作者：
Deneen B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Glasgow SM;Carlson JC;Zhu W;Chaboub LS;Kang P;Lee HK;Clovis YM;Lozzi BE;McEvilly RJ;Rosenfeld MG;Creighton CJ;Lee SK;Mohila CA;Deneen B
长距离增强子相互作用关键地调节基因表达，然而关于它们的协调活动如何促进CNS发育，或者这如何反过来与疾病状态相关，知之甚少。通过研究转录因子NFIA在发育中的脊髓中的调节，我们确定了在体内概括神经胶质和神经元谱系的NFIA表达的长程增强子。互补遗传研究发现，Sox 9/Brn 2和Isl 1/Lhx 3调节增强子活性和神经胶质细胞和神经元群体中的NFIA表达。染色质构象分析（3C）显示，这些增强子和转录因子在脊髓中的这些谱系内形成不同的结构。在神经胶质瘤模型中，胶质细胞特异性结构存在于肿瘤中，并且这些增强子是NFIA表达所需的，并有助于神经胶质瘤形成。通过描绘基因表达调控的三维机制，我们的研究确定了谱系特异性染色质结构和相关的增强子，调节CNS中的细胞命运和肿瘤发生。
Long-range enhancer interactions critically regulate gene expression, yet little is known about how their coordinated activities contribute to CNS development, or how this may in turn relate to disease states. By examining the regulation of the transcription factor NFIA in the developing spinal cord, we identified long-range enhancers that recapitulate NFIA expression across glial and neuronal lineages in vivo. Complementary genetic studies found that Sox9/Brn2 and Isl1/Lhx3 regulate enhancer activity and NFIA expression in glial and neuronal populations. Chromatin conformation analysis (3C) revealed that these enhancers and transcription factors form distinct architectures within these lineages in the spinal cord. In glioma models, the glial-specific architecture is present in tumors, and these enhancers are required for NFIA expression and contribute to glioma formation. By delineating three-dimensional mechanisms of gene expression regulation, our studies identify lineage specific chromatin architectures and associated enhancers that regulate cell fate and tumorigenesis in the CNS.
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影响因子：
8.8
作者：
Gundry MC;Brunetti L;Lin A;Mayle AE;Kitano A;Wagner D;Hsu JI;Hoegenauer KA;Rooney CM;Goodell MA;Nakada D
通讯作者：
Nakada D
影响因子：
25
作者：
Glasgow, Stacey M.;Zhu, Wenyi;Stolt, C. Claus;Huang, Teng-Wei;Chen, Fuyi;LoTurco, Joseph J.;Neul, Jeffrey L.;Wegner, Michael;Mohila, Carrie;Deneen, Benjamin
通讯作者：
Deneen, Benjamin
影响因子：
25
作者：
John Lin CC;Yu K;Hatcher A;Huang TW;Lee HK;Carlson J;Weston MC;Chen F;Zhang Y;Zhu W;Mohila CA;Ahmed N;Patel AJ;Arenkiel BR;Noebels JL;Creighton CJ;Deneen B
通讯作者：
Deneen B
DOI：
10.1073/pnas.1018279108
发表时间：
2011-05-03
影响因子：
11.1
作者：
Kim, Yoon Jung;Cecchini, Katharine R.;Kim, Tae Hoon
通讯作者：
Kim, Tae Hoon
影响因子：
10.5
作者：
Akiyama, H;Chaboissier, MC;de Crombrugghe, B
通讯作者：
de Crombrugghe, B