RNAget: an API to securely retrieve RNA quantifications.
RNAget: an API to securely retrieve RNA quantifications.
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RNAGET：API可安全检索RNA定量。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btad126
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发表时间：
2023-04-03
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
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作者：
基因组定量数据的大规模共享需要标准化的访问接口。在这个全球基因组学与健康联盟项目中，我们开发了 RNAget，这是一种用于安全访问矩阵形式的基因组定量数据的 API。 RNAget 提供切片矩阵以提取所需的数据子集，并且适用于所有表达矩阵格式的数据，包括 RNA 测序和微阵列。此外，它还推广到其他基于序列的基因组学的量化矩阵，例如 ATAC-seq 和 ChIP-seq。 https://ga4gh-rnaseq.github.io/schema/docs/index.html。
Large-scale sharing of genomic quantification data requires standardized access interfaces. In this Global Alliance for Genomics and Health project, we developed RNAget, an API for secure access to genomic quantification data in matrix form. RNAget provides for slicing matrices to extract desired subsets of data and is applicable to all expression matrix-format data, including RNA sequencing and microarrays. Further, it generalizes to quantification matrices of other sequence-based genomics such as ATAC-seq and ChIP-seq. https://ga4gh-rnaseq.github.io/schema/docs/index.html.
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影响因子：
12.3
作者：
Wolf FA;Angerer P;Theis FJ
通讯作者：
Theis FJ
影响因子：
48
作者：
Mortazavi, Ali;Williams, Brian A.;Wold, Barbara
通讯作者：
Wold, Barbara
影响因子：
9.3
作者：
Bujold, David;Morais, David Anderson de Lima;Bourque, Guillaume
通讯作者：
Bourque, Guillaume
DOI：
10.1016/j.xgen.2021.100029
发表时间：
2021-11-10
期刊：
CELL GENOMICS
影响因子：
--
作者：
Rehm, Heidi L.;Page, Angela J. H.;Birney, Ewan
通讯作者：
Birney, Ewan
影响因子：
12.3
作者：
Haque A;Engel J;Teichmann SA;Lönnberg T
通讯作者：
Lönnberg T