IMP 2.0: a multi-species functional genomics portal for integration, visualization and prediction of protein functions and networks.
IMP 2.0: a multi-species functional genomics portal for integration, visualization and prediction of protein functions and networks.
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DOI：
10.1093/nar/gkv486
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发表时间：
2015-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Troyanskaya OG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wong AK;Krishnan A;Yao V;Tadych A;Troyanskaya OG
IMP (Integrative Multi-species Prediction)，最初发布于2012年，是一个交互式网络服务器，使分子生物学家能够解释实验结果，并在大型跨生物功能预测和网络纲要的背景下产生假设。该系统为生物学家提供了一个框架，在功能网络的背景下分析他们的候选基因集，使用从集成的高通量数据预测的功能关系扩展或精炼他们的集。IMP 2.0整合了过去三年在七个支持生物（智人、小家鼠、褐家鼠、黑胃果蝇、斑马鱼、秀丽隐杆线虫和酿酒酵母）中更新的先验知识和数据收集，并将功能预测范围扩展到包括人类疾病。IMP识别具有疾病知识转移保守功能角色的同源物，使生物学家能够分析所有生物体的疾病背景和预测。此外，IMP 2.0实现了一个新的灵活平台，供专家生成关于生物过程或疾病的定制假设，使研究人员可以轻松获取复杂的数据驱动方法。IMP不需要任何注册或安装，可以在http://imp.princeton.edu上免费使用。
IMP (Integrative Multi-species Prediction), originally released in 2012, is an interactive web server that enables molecular biologists to interpret experimental results and to generate hypotheses in the context of a large cross-organism compendium of functional predictions and networks. The system provides biologists with a framework to analyze their candidate gene sets in the context of functional networks, expanding or refining their sets using functional relationships predicted from integrated high-throughput data. IMP 2.0 integrates updated prior knowledge and data collections from the last three years in the seven supported organisms (Homo sapiens, Mus musculus, Rattus norvegicus, Drosophila melanogaster, Danio rerio, Caenorhabditis elegans, and Saccharomyces cerevisiae) and extends function prediction coverage to include human disease. IMP identifies homologs with conserved functional roles for disease knowledge transfer, allowing biologists to analyze disease contexts and predictions across all organisms. Additionally, IMP 2.0 implements a new flexible platform for experts to generate custom hypotheses about biological processes or diseases, making sophisticated data-driven methods easily accessible to researchers. IMP does not require any registration or installation and is freely available for use at http://imp.princeton.edu.
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影响因子：
4.3
作者：
Guan Y;Gorenshteyn D;Burmeister M;Wong AK;Schimenti JC;Handel MA;Bult CJ;Hibbs MA;Troyanskaya OG
通讯作者：
Troyanskaya OG
影响因子：
14.9
作者：
Franceschini A;Szklarczyk D;Frankild S;Kuhn M;Simonovic M;Roth A;Lin J;Minguez P;Bork P;von Mering C;Jensen LJ
通讯作者：
Jensen LJ
影响因子：
14.9
作者：
Schmitt T;Ogris C;Sonnhammer EL
通讯作者：
Sonnhammer EL
影响因子：
14.9
作者：
Licata L;Briganti L;Peluso D;Perfetto L;Iannuccelli M;Galeota E;Sacco F;Palma A;Nardozza AP;Santonico E;Castagnoli L;Cesareni G
通讯作者：
Cesareni G
DOI：
10.1038/nrg2934
发表时间：
2011-02
期刊：
Nature reviews. Genetics
影响因子：
--
作者：
通讯作者：
--