Widespread changes in the posttranscriptional landscape at the Drosophila oocyte-to-embryo transition.
Widespread changes in the posttranscriptional landscape at the Drosophila oocyte-to-embryo transition.
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DOI：
10.1016/j.celrep.2014.05.002
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发表时间：
2014-06-12
期刊：
影响因子：
8.8
通讯作者：
Orr-Weaver TL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kronja I;Yuan B;Eichhorn SW;Dzeyk K;Krijgsveld J;Bartel DP;Orr-Weaver TL
卵母细胞到胚胎的转变标志着发育的开始。从分化的卵母细胞到全能胚胎的这种深刻变化的初始阶段发生在转录和mRNA降解都不存在的情况下。在这里，我们结合联合收割机的全球多核糖体分析，核糖体足迹分析，定量质谱分析在一个全面的方法来描绘在果蝇的翻译和蛋白质组学的变化，在这个重要的过渡。我们的研究结果表明，PNG激酶是一个重要的调节广泛的变化，在翻译组，独特的作用在这个发展窗口。png突变体中蛋白质组的分析提供了对翻译对蛋白质水平变化的贡献的见解，揭示了在全能性恢复时蛋白质组重塑期间翻译和蛋白质周转之间的补偿动态。蛋白质组的变化还表明了减数分裂和早期胚胎发生的新调节因子，包括保守的H3K4脱甲基酶LID，我们证明了尽管转录不活跃，但在此期间需要该酶。
The oocyte-to-embryo transition marks the onset of development. The initial phase of this profound change from the differentiated oocyte to the totipotent embryo occurs in the absence of both transcription and mRNA degradation. Here we combine global polysome profiling, ribosome-footprint profiling, and quantitative mass spectrometry in a comprehensive approach to delineate the translational and proteomic changes at this important transition in Drosophila. Our results show that PNG kinase is a critical regulator of the extensive changes in the translatome, acting uniquely at this developmental window. Analysis of the proteome in png mutants provided insights into the contributions of translation to changes in protein levels, revealing a compensatory dynamic between translation and protein turnover during proteome remodeling at the return to totipotency. The proteome changes additionally suggested new regulators of meiosis and early embryogenesis, including the conserved H3K4 demethylase LID, which we demonstrated is required during this period despite transcriptional inactivity.
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核糖体分析揭示了果蝇果蝇中普遍存在的终止密码子读取。
影响因子：
7.7
作者：
Dunn JG;Foo CK;Belletier NG;Gavis ER;Weissman JS
通讯作者：
Weissman JS
DOI：
10.1083/jcb.201302139
发表时间：
2013-09-30
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Kotani T;Yasuda K;Ota R;Yamashita M
通讯作者：
Yamashita M
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
影响因子：
4.4
作者：
Cox, Juergen;Neuhauser, Nadin;Mann, Matthias
通讯作者：
Mann, Matthias
DOI：
10.1093/bfgp/3.2.103
发表时间：
2004-08-01
期刊：
Briefings in Functional Genomics & Proteomics
影响因子：
--
作者：
Beilharz, Traude H.;Preiss, Thomas
通讯作者：
Preiss, Thomas