Phylogenetic classification of transporters and other membrane proteins from Saccharomyces cerevisiae
Phylogenetic classification of transporters and other membrane proteins from Saccharomyces cerevisiae
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酿酒酵母转运蛋白和其他膜蛋白的系统发育分类
DOI：
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发表时间：
2002
影响因子：
2.9
通讯作者：
A. Goffeau
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Benoît De Hertogh;E. Carvajal;E. Talla;B. Dujon;P. Baret;A. Goffeau
抽象的。功能和系统发育的标准的基础上，我们已经确定了总共229个亚家族和111个单基因预测进行运输或其他膜功能的酿酒酵母。我们扩展了转运蛋白分类（TC），并为非转运蛋白膜蛋白创建了膜分类（MC）。使用初步的系统发育数字X，Y，Z（分别为新的家庭，亚家族，和集群），我们分配了一个五位数的850蛋白预测含有两个以上的跨膜结构域。与以前的TC的酵母基因组相比，我们分类的538个膜蛋白（转运蛋白和非转运蛋白），并确定了111个新的系统发育亚科。
Abstract. On the basis of functional and phylogenetic criteria, we have identified a total of 229 subfamilies and 111 singletons predicted to carry out transport or other membrane functions in Saccharomyces cerevisiae. We have extended the Transporter Classification (TC) and created a Membrane Classification (MC) for non-transporter membrane proteins. Using the preliminary phylogenetic digits X, Y, Z (for new families, subfamilies, and clusters, respectively), we allocated a five-digit number to 850 proteins predicted to contain more than two transmembrane domains. Compared with a previous TC of the yeast genome, we classified an additional set of 538 membrane proteins (transporters and non-transporters) and identified 111 novel phylogenetic subfamilies.
影响因子：
5.4
作者：
M. Saier
通讯作者：
M. Saier
影响因子：
2.8
作者：
Jack, DL;Paulsen, IT;Saier, MH
通讯作者：
Saier, MH
影响因子：
5.6
作者：
Nelson, DR;Felix, CM;Swanson, JM
通讯作者：
Swanson, JM