ENCODE data in the UCSC Genome Browser: year 5 update.
ENCODE data in the UCSC Genome Browser: year 5 update.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gks1172
复制
发表时间：
2013-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kent WJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rosenbloom KR;Sloan CA;Malladi VS;Dreszer TR;Learned K;Kirkup VM;Wong MC;Maddren M;Fang R;Heitner SG;Lee BT;Barber GP;Harte RA;Diekhans M;Long JC;Wilder SP;Zweig AS;Karolchik D;Kuhn RM;Haussler D;Kent WJ
DNA元件百科全书（ENCODE），http://encodeproject.org，已经完成了第五年的科学合作，以创建一个全面的人类基因组功能元件目录，以及第三年的小鼠基因组研究。自本刊上一篇报道以来，ENCODE人类数据库增加了898个新实验（总计2886个），并进行了主要的综合分析。在小鼠基因组方面，今年有404个新实验的结果可用，在项目过程中收集的总数增加到583个。位于圣克鲁斯的加州大学将这些数据发布在公共基因组浏览器http://genome.ucsc.edu上，以进行可视化浏览和数据挖掘。支持下载原始数据和处理后的数据文件。ENCODE门户网站提供有关ENCODE数据集的专门工具和信息。
The Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE), http://encodeproject.org, has completed its fifth year of scientific collaboration to create a comprehensive catalog of functional elements in the human genome, and its third year of investigations in the mouse genome. Since the last report in this journal, the ENCODE human data repertoire has grown by 898 new experiments (totaling 2886), accompanied by a major integrative analysis. In the mouse genome, results from 404 new experiments became available this year, increasing the total to 583, collected during the course of the project. The University of California, Santa Cruz, makes this data available on the public Genome Browser http://genome.ucsc.edu for visual browsing and data mining. Download of raw and processed data files are all supported. The ENCODE portal provides specialized tools and information about the ENCODE data sets.
登录
查看更多内容
影响因子：
7
作者：
Wang J;Zhuang J;Iyer S;Lin X;Whitfield TW;Greven MC;Pierce BG;Dong X;Kundaje A;Cheng Y;Rando OJ;Birney E;Myers RM;Noble WS;Snyder M;Weng Z
通讯作者：
Weng Z
影响因子：
12.3
作者：
Li G;Fullwood MJ;Xu H;Mulawadi FH;Velkov S;Vega V;Ariyaratne PN;Mohamed YB;Ooi HS;Tennakoon C;Wei CL;Ruan Y;Sung WK
通讯作者：
Sung WK
影响因子：
7
作者：
Harrow J;Frankish A;Gonzalez JM;Tapanari E;Diekhans M;Kokocinski F;Aken BL;Barrell D;Zadissa A;Searle S;Barnes I;Bignell A;Boychenko V;Hunt T;Kay M;Mukherjee G;Rajan J;Despacio-Reyes G;Saunders G;Steward C;Harte R;Lin M;Howald C;Tanzer A;Derrien T;Chrast J;Walters N;Balasubramanian S;Pei B;Tress M;Rodriguez JM;Ezkurdia I;van Baren J;Brent M;Haussler D;Kellis M;Valencia A;Reymond A;Gerstein M;Guigó R;Hubbard TJ
通讯作者：
Hubbard TJ
影响因子：
9.8
作者：
ENCODE Project Consortium
通讯作者：
ENCODE Project Consortium
影响因子：
14.9
作者：
Dreszer TR;Karolchik D;Zweig AS;Hinrichs AS;Raney BJ;Kuhn RM;Meyer LR;Wong M;Sloan CA;Rosenbloom KR;Roe G;Rhead B;Pohl A;Malladi VS;Li CH;Learned K;Kirkup V;Hsu F;Harte RA;Guruvadoo L;Goldman M;Giardine BM;Fujita PA;Diekhans M;Cline MS;Clawson H;Barber GP;Haussler D;James Kent W
通讯作者：
James Kent W