Identification of IS 1206, a Corynebacterium glutamicum IS3‐related insertion sequence and phylogenetic analysis
Identification of IS 1206, a Corynebacterium glutamicum IS3‐related insertion sequence and phylogenetic analysis
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谷氨酸棒杆菌 IS3 相关插入序列 IS 1206 的鉴定和系统发育分析
DOI：
10.1111/j.1365-2958.1994.tb02190.x
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发表时间：
1994
影响因子：
3.6
通讯作者：
G. Leblon
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
C. Bonamy;J. Labarre;O. Reyes;G. Leblon
将质粒pCGL320整合到谷氨酸棒状杆菌ATCC21086衍生物中，获得了插入质粒的串联扩增（Labarre et a/）。, 1993)。其中一个扩增事件与我们命名为IS 1206的插入序列整合有关。杂交序列仅存在于谷氨酸C.菌株中，且拷贝数不同。IS1206全长1290bp，携带32bp的不完全反向重复序列，在插入时产生3bp的目标DNA复制。IS1206具有IS3家族的特征，部分DNA序列集中在假定的转座酶区（orfB）上，与IS3和其他一些相关元件相似。orfB从is1206和IS3相关元件中推断出的蛋白质序列的系统发育分析与物种的系统发育相矛盾，表明这些元件的进化可能是复杂的。水平迁移可以被调用，但其他替代，如祖先多态性或/和不同的进化速率也可能涉及。
Integration of plasmid pCGL320 into a Corynebacterium glutamicum ATCC21086 derivative led to tandem amplification of the inserted plasmid (Labarre et a/., 1993). One amplification event was associated with integration of an insertion sequence that we have named IS 1206. Hybridizing sequences were only found in C. glutamicum strains and at various copy numbers. IS1206 is 1290bp long, carries 32 bp imperfect inverted repeats and generates a 3bp duplication of the target DNA upon insertion. IS1206 presents the features characteristic of the IS3 family and part of the DNA sequence centering on the putative transposase region (orfB) is similar to those of IS3 and some other related elements. Phylogenetic analysis of orfB deduced protein sequences from IS 1206 and IS3‐related elements contradicts the phylogeny of the species, suggesting that evolution of these elements might be complex. Horizontal transfer could be invoked but other alternatives like ancestral polymorphism or/and different rates of evolution could also be involved.
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