PDB ProtVista: A reusable and open-source sequence feature viewer
PDB ProtVista: A reusable and open-source sequence feature viewer
复制标题
PDB ProtVista：可重用的开源序列特征查看器
DOI：
10.1101/2022.07.22.500790
复制
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Deshpande M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Deshpande M
PDB ProtVista是一个可重复使用和可定制的序列功能查看器，它提供残留物水平注释的直观和详细的2D可视化，同时还支持与3D查看器的互动交流。欧洲蛋白质数据库(PDBe)团队开发和维护蛋白质数据库ProtVista。一些Web服务使用它来显示结构和功能注释，如大分子相互作用界面、内在无序预测、序列变体和序列保守性。可用性和实现PDB ProtVista是可从https://github.com/PDBeurope/protvista-pdb.免费获得的原生脚本(ES6)应用程序上述URL还提供了关于将PDB ProtVista与现有网络应用程序和3D分子查看器集成的广泛文档和分步用户指南。它还提供了一个示例，说明如何显示用户的自定义数据以及由一组丰富的PDBe API端点支持的PDB和UniProt条目的功能注释。
The PDB ProtVista is a reusable and customisable sequence feature viewer that provides intuitive and detailed 2D visualisation of residue-level annotations while also supporting interactive communication with 3D viewers. The Protein Data Bank in Europe (PDBe) team develops and maintains PDB ProtVista. Several web services use it to display structural and functional annotations such as macromolecular interaction interfaces, intrinsic disorder predictions, sequence variants, and sequence conservation.Availability and ImplementationThe PDB ProtVista is a native JavaScript (ES6) application that is freely available from https://github.com/PDBeurope/protvista-pdb. The above URL also provides extensive documentation and step-by-step user guides on integrating PDB ProtVista with existing web applications and 3D molecular viewers. It also offers an example of how to display custom data of the user and functional annotations for PDB and UniProt entries powered by a rich set of PDBe API endpoints.
登录
查看更多内容
影响因子：
14.9
作者：
wwPDB consortium
通讯作者：
wwPDB consortium
TBP功能创新的分子决定因素及其对转录起始的影响
影响因子：
16.6
作者：
C. Ravarani;T. Flock;T. Flock;S. Chavali;S. Chavali;M. Anandapadamanaban;M. Babu;S. Balaji
通讯作者：
S. Balaji
影响因子：
14.9
作者：
UniProt Consortium
通讯作者：
UniProt Consortium
影响因子：
5.8
作者：
Paladin, Lisanna;Schaeffer, Mathieu;Bairoch, Amos
通讯作者：
Bairoch, Amos
影响因子：
5.8
作者：
Mukhyala, Kiran;Masselot, Alexandre
通讯作者：
Masselot, Alexandre