Full genome re-sequencing reveals a novel circadian clock mutation in Arabidopsis.
Full genome re-sequencing reveals a novel circadian clock mutation in Arabidopsis.
复制标题
DOI：
10.1186/gb-2011-12-3-r28
复制
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Hall A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ashelford K;Eriksson ME;Allen CM;D'Amore R;Johansson M;Gould P;Kay S;Millar AJ;Hall N;Hall A
在拟南芥中基于图谱的克隆可能是一个困难和耗时的过程，特别是如果表型是微妙的和评分劳动密集型。在这里，我们已经重新测序的120-Mb的基因组的一种新的拟南芥时钟突变早期的鸟类（ebi-1）在Wassilewskija（Ws-2）。我们证明了在限制考虑的SNP数量中对回交系进行测序的实用性。我们确定基因AtNFXL-2中的SNP可能是ebi-1表型的原因。
Map based cloning in Arabidopsis thaliana can be a difficult and time-consuming process, specifically if the phenotype is subtle and scoring labour intensive. Here, we have re-sequenced the 120-Mb genome of a novel Arabidopsis clock mutant early bird (ebi-1) in Wassilewskija (Ws-2). We demonstrate the utility of sequencing a backcrossed line in limiting the number of SNPs considered. We identify a SNP in the gene AtNFXL-2 as the likely cause of the ebi-1 phenotype.
登录
查看更多内容
影响因子：
56.9
作者：
Harmer, SL;Hogenesch, LB;Kay, SA
通讯作者：
Kay, SA
影响因子：
56.9
作者：
Lynn, A;Koehler, KE;Hassold, TJ
通讯作者：
Hassold, TJ
影响因子：
12.3
作者：
Covington, Michael F.;Maloof, Julin N.;Straume, Marty;Kay, Steve A.;Harmer, Stacey L.
通讯作者：
Harmer, Stacey L.
影响因子：
11.6
作者：
Gould, PD;Locke, JCW;Hall, A
通讯作者：
Hall, A
影响因子：
56.9
作者：
Clark, Richard M.;Schweikert, Gabriele;Weigel, Detlef
通讯作者：
Weigel, Detlef