Marinicauda pacifica gen. nov., sp. nov., a prosthecate alphaproteobacterium of the family Hyphomonadaceae isolated from deep seawater.
Marinicauda pacifica gen. nov., sp. nov., a prosthecate alphaproteobacterium of the family Hyphomonadaceae isolated from deep seawater.
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太平洋海蜈蚣
DOI：
10.1099/ijs.0.046656-0
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发表时间：
2013-06
影响因子：
2.8
通讯作者：
Yu-Zhong Zhang
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhong Xu;Xiu-Lan Chen;Bai-Cheng Zhou;Yu-Zhong Zhang
从太平洋深海中分离到一株海洋假囊菌，命名为P-1 km-3（T）。菌株P-1 km-3（T）的细胞为革兰氏染色阴性、需氧、过氧化氢酶和氧化酶阳性、具有单极前鞘或鞭毛的二型杆状细胞。该菌株水解明胶并在6-40 °C（最佳，30 °C）和0.5-12%（w/v）NaCl（最佳，2%）下生长。16 S rRNA基因序列的系统发育分析表明，菌株P-1 km-3（T）属于α变形菌纲丝单胞菌科，代表一个独立的谱系，位于Oceanicaulis和Woodsholea属之间。P-1 km-3（T）菌株与Oceanicaulis和Woodsholea属的模式菌株的序列相似性为93.2- 93.9%。菌株P-1 km-3（T）的主要脂肪酸为C18：1ω 7 c、C18：0、11-甲基C18：1ω 7 c、C17：0和C19：0环ω 8 c。菌株P-1 km-3（T）的主要呼吸醌为Q-10。菌株P-1 km-3（T）的极性脂质包括葡萄糖醛酸吡喃糖基甘油二酯（GUDG）、单糖基甘油二酯（MGDG）、磺基奎诺糖基甘油二酯（SQDG）、磷脂酰甘油（PG）、一种未鉴定的磷脂（PL）和一种未鉴定的脂质（L）。菌株P-1 km-3（T）基因组DNA G+C含量为66.0mol%。根据本研究中所提供的多相数据，提出菌株P-1 km-3（T）代表一个新属中的一个新种，太平洋海尾虫（Marinicauda pacifica gen. nov.）sp. nov.，属于丝单胞菌科。模式种的模式株为P-1 km-3（T）（=KACC 16526（T）=CGMCC 1.11031（T））。
A marine prosthecate bacterium, designated strain P-1 km-3(T), was isolated from deep seawater from the Pacific. Cells of strain P-1 km-3(T) were Gram-stain-negative, aerobic, catalase- and oxidase-positive, dimorphic rods with a single polar prostheca or flagellum. The strain hydrolysed gelatin and grew at 6-40 °C (optimum, 30 °C) and with 0.5-12% (w/v) NaCl (optimum, 2%). Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences revealed that strain P-1 km-3(T) belonged to the family Hyphomonadaceae in the class Alphaproteobacteria and represented a separate lineage, located between the genera Oceanicaulis and Woodsholea. Sequence similarities of strain P-1 km-3(T) with type strains of species of the genera Oceanicaulis and Woodsholea were 93.2-93.9%. The predominant cellular fatty acids in strain P-1 km-3(T) were C18:1ω7c, C18:0, 11-methyl C18:1ω7c, C17:0 and C19:0 cyclo ω8c. The major respiratory quinone of strain P-1 km-3(T) was Q-10. The polar lipids of strain P-1 km-3(T) comprised glucuronopyranosyldiglyceride (GUDG), monoglycosyldiglyceride (MGDG), sulfo-quinovosyl diacylglycerol (SQDG), phosphatidylglycerol (PG), an unidentified phospholipid (PL) and an unidentified lipid (L). The genomic DNA G+C content of strain P-1 km-3(T) was 66.0 mol%. On the basis of the polyphasic data presented in this study, strain P-1 km-3(T) is proposed to represent a novel species in a new genus, Marinicauda pacifica gen. nov., sp. nov., within the family Hyphomonadaceae. The type strain of the type species is P-1 km-3(T) (=KACC 16526(T)=CGMCC 1.11031(T)).
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DOI：
10.1007/s12275-008-0290-0
发表时间：
2009-05
期刊：
The Journal of Microbiology
影响因子：
--
作者：
Zhe-Xue Quail;Dan-Ning Zeng;Yi-ping Xiao;S. Roh;Y. Nam;Ho-Won Chang;J. Yoon;H. Oh;J. Bae
通讯作者：
Zhe-Xue Quail;Dan-Ning Zeng;Yi-ping Xiao;S. Roh;Y. Nam;Ho-Won Chang;J. Yoon;H. Oh;J. Bae
DOI：
10.1099/ijs.0.020396-0
发表时间：
2011-04
影响因子：
2.8
作者：
S. H. Lee;J. Shim;J. Kim;Hyung-Kyoon Choi;C. Jeon
通讯作者：
S. H. Lee;J. Shim;J. Kim;Hyung-Kyoon Choi;C. Jeon
DOI：
--
发表时间：
1994-10
期刊：
--
影响因子：
--
作者：
R. Murray;R. Doetsch;C. Robinow
通讯作者：
R. Murray;R. Doetsch;C. Robinow
DOI：
10.1099/00207713-40-4-443
发表时间：
1990-10-01
期刊：
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY
影响因子：
--
作者：
SCHLESNER, H;BARTELS, C;STACKEBRANDT, E
通讯作者：
STACKEBRANDT, E
影响因子：
10.7
作者：
SAITOU, N;NEI, M
通讯作者：
NEI, M