High-Throughput Mapping of Single-Neuron Projections by Sequencing of Barcoded RNA.
High-Throughput Mapping of Single-Neuron Projections by Sequencing of Barcoded RNA.
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DOI：
10.1016/j.neuron.2016.07.036
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发表时间：
2016-09-07
期刊：
影响因子：
16.2
通讯作者：
Zador AM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kebschull JM;Garcia da Silva P;Reid AP;Peikon ID;Albeanu DF;Zador AM
神经元通过长距离轴突投射将信息传递到遥远的大脑区域。在小鼠中，区域到区域的连接仅使用批量标记技术系统地映射，这掩盖了混合的单个神经元的不同投射。在这里，我们描述了MAPseq（测序投影的多重分析），这是一种可以通过用随机RNA序列（“条形码”）标记大量神经元来映射数千甚至数百万单个神经元的投影的技术。用条形码mRNA填充轴突，解剖每个推定的投射区域，并提取条形码mRNA并测序。将MAPseq应用于蓝斑（LC），我们发现单个LC神经元具有优选的皮质靶点。通过将传统上被视为显微镜问题的神经解剖学重新塑造为测序问题，MAPseq利用测序技术的进步来实现对大脑回路的高通量询问。
Neurons transmit information to distant brain regions via long-range axonal projections. In the mouse, area-to-area connections have only been systematically mapped using bulk labeling techniques, which obscure the diverse projections of intermingled single neurons. Here we describe MAPseq (Multiplexed Analysis of Projections by Sequencing), a technique that can map the projections of thousands or even millions of single neurons by labeling large sets of neurons with random RNA sequences ("barcodes"). Axons are filled with barcode mRNA, each putative projection area is dissected, and the barcode mRNA is extracted and sequenced. Applying MAPseq to the locus coeruleus (LC), we find that individual LC neurons have preferred cortical targets. By recasting neuroanatomy, which is traditionally viewed as a problem of microscopy, as a problem of sequencing, MAPseq harnesses advances in sequencing technology to permit high-throughput interrogation of brain circuits.
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影响因子：
25
作者：
Glickfeld, Lindsey L.;Andermann, Mark L.;Bonin, Vincent;Reid, R. Clay
通讯作者：
Reid, R. Clay
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64.8
作者：
Navin N;Kendall J;Troge J;Andrews P;Rodgers L;McIndoo J;Cook K;Stepansky A;Levy D;Esposito D;Muthuswamy L;Krasnitz A;McCombie WR;Hicks J;Wigler M
通讯作者：
Wigler M
影响因子：
64.8
作者：
Ghosh, Sulagna;Larson, Stephen D.;Baldwin, Kristin K.
通讯作者：
Baldwin, Kristin K.
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7.7
作者：
Economo MN;Clack NG;Lavis LD;Gerfen CR;Svoboda K;Myers EW;Chandrashekar J
通讯作者：
Chandrashekar J
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3
作者：
Chandler, Daniel;Waterhouse, Barry D.
通讯作者：
Waterhouse, Barry D.