Comparison of multiple displacement amplification (MDA) and multiple annealing and looping-based amplification cycles (MALBAC) in single-cell sequencing.
Comparison of multiple displacement amplification (MDA) and multiple annealing and looping-based amplification cycles (MALBAC) in single-cell sequencing.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0114520
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发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Ling F
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chen M;Song P;Zou D;Hu X;Zhao S;Gao S;Ling F
单细胞测序促进了我们对细胞群体异质性的理解，包括不同代细胞之间的单倍型和基因组变异性。全基因组扩增对于为单细胞测序项目产生足够的DNA片段至关重要。利用单精子的测序数据，我们定量比较了两种广泛应用于单细胞测序的主流扩增方法，多重置换扩增（MDA）和多重退火和基于环的扩增循环（MALBAC）。我们的研究结果表明，MALBAC，作为一个修改的MDA和调整PCR的组合，具有更高水平的均匀性，特异性和重复性。
Single-cell sequencing promotes our understanding of the heterogeneity of cellular populations, including the haplotypes and genomic variability among different generation of cells. Whole-genome amplification is crucial to generate sufficient DNA fragments for single-cell sequencing projects. Using sequencing data from single sperms, we quantitatively compare two prevailing amplification methods that extensively applied in single-cell sequencing, multiple displacement amplification (MDA) and multiple annealing and looping-based amplification cycles (MALBAC). Our results show that MALBAC, as a combination of modified MDA and tweaked PCR, has a higher level of uniformity, specificity and reproducibility.
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影响因子：
14.9
作者：
NCBI Resource Coordinators
通讯作者：
NCBI Resource Coordinators
影响因子：
3.5
作者：
Lasken, Roger S;Stockwell, Timothy B
通讯作者：
Stockwell, Timothy B
DOI：
10.1073/pnas.89.13.5847
发表时间：
1992-07-01
影响因子：
11.1
作者：
ZHANG, L;CUI, XF;ARNHEIM, N
通讯作者：
ARNHEIM, N
影响因子：
3.9
作者：
Lasken, Roger S.
通讯作者：
Lasken, Roger S.
影响因子：
64.5
作者：
Hou, Yong;Song, Luting;Wang, Jun
通讯作者：
Wang, Jun