Split Spinach Aptamer for Highly Selective Recognition of DNA and RNA at Ambient Temperatures.
Split Spinach Aptamer for Highly Selective Recognition of DNA and RNA at Ambient Temperatures.
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DOI：
10.1002/cbic.201600323
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发表时间：
2016-09-02
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Kolpashchikov DM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kikuchi N;Kolpashchikov DM
设计并测试了用于核酸荧光分析的分裂菠菜适体（SSA）探针。在 SSA 设计中，两条 RNA 或 RNA/DNA 链与特定的核酸分析物杂交，形成 DFHBI 染料的结合位点，同时荧光增加高达 270 倍。与最先进的荧光探针相比，SSA 探针的主要优点是高选择性：即使在室温下，在存在单碱基错配分析物的情况下，它也仅产生背景荧光。 SSA 是一种在环境温度下进行无标记核酸分析的有前途的工具。两条链（SSA_m 和 SSA_f）与 DNA 或 RNA 分析物杂交并形成有机染料 DFHBI 的结合位点。 DFHBI 的结合导致荧光增强高达 270 倍。该探针在环境温度下对单碱基错配具有高度选择性。
Split spinach aptamer (SSA) probes for fluorescent analysis of nucleic acids were designed and tested. In SSA design, two RNA or RNA/DNA strands hybridized to a specific nucleic acid analyte and formed a binding site for DFHBI dye, which was accompanied by up to 270-fold increase in fluorescence. The major advantage of the SSA probe over state-of-the art fluorescent probes is high selectivity: it produces only the background fluorescence in the presence of single base mismatched analyte even at room temperature. SSA is a promising tool for label-free analysis of nucleic acids at ambient temperatures. Two strands (SSA_m and SSA_f) hybridize to DNA or RNA analyte and form a binding site for organic dye DFHBI. Binding of DFHBI results in up to 270-fold fluorescence increase. The probe is highly selective to a single base mismatch at ambient temperatures.
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DOI：
10.3390/molecules181215357
发表时间：
2013-12-11
期刊：
Molecules (Basel, Switzerland)
影响因子：
--
作者：
Boutorine AS;Novopashina DS;Krasheninina OA;Nozeret K;Venyaminova AG
通讯作者：
Venyaminova AG
影响因子：
14.9
作者：
Autour A;Westhof E;Ryckelynck M
通讯作者：
Ryckelynck M
DOI：
10.1039/c5cc01526j
发表时间：
2015-05-28
期刊：
Chemical communications (Cambridge, England)
影响因子：
--
作者：
DasGupta S;Shelke SA;Li NS;Piccirilli JA
通讯作者：
Piccirilli JA
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影响因子：
16.6
作者：
Guet D;Burns LT;Maji S;Boulanger J;Hersen P;Wente SR;Salamero J;Dargemont C
通讯作者：
Dargemont C
影响因子：
4.9
作者：
Kato, Teru;Shimada, Ippei;Hyuga, Masumi
通讯作者：
Hyuga, Masumi