Screening helix-threading peptides for RNA binding using a thiazole orange displacement assay.
Screening helix-threading peptides for RNA binding using a thiazole orange displacement assay.
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DOI：
10.1016/j.bmc.2008.08.066
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发表时间：
2008-10-01
影响因子：
3.5
通讯作者：
Beal PA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Krishnamurthy M;Schirle NT;Beal PA
噻唑橙荧光插层置换法已适用于rna结合螺旋线肽（HTPs）的研究。该分析对htp结合rna高度敏感，并提供与定量核糖核酸酶足迹非常一致的结合亲和力数据，而无需放射性标记或凝胶电泳。FID分析用于确定一个小的螺旋线肽库的结构活性关系。这些研究结果表明，它们的RNA结合依赖于肽序列、α-氨基酸立体化学和环化（相对于线性肽），但与所分析的五肽、四肽和三肽的大环大小无关。
The fluorescent intercalator displacement assay using thiazole orange has been adapted to the study of RNA-binding helix-threading peptides (HTPs). This assay is highly sensitive with HTP-binding RNAs and provides binding affinity data in good agreement with quantitative ribonuclease footprinting without the need for radiolabeling or gel electrophoresis. The FID assay was used to define structure activity relationships for a small library of helix-threading peptides. Results of these studies indicate their RNA binding is dependent on peptide sequence, α-amino acid stereochemistry, and cyclization (versus linear peptides), but independent of macrocyclic ring size for the penta-, tetra- and tri peptides analyzed.
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影响因子：
15
作者：
Boger, DL;Fink, BE;Hedrick, MP
通讯作者：
Hedrick, MP
DOI：
10.1073/pnas.0703961104
发表时间：
2007-09-04
影响因子：
11.1
作者：
Win, Maung Nyan;Smolke, Christina D.
通讯作者：
Smolke, Christina D.
影响因子：
--
作者：
Kwon, Yong-Uk;Kodadek, Thomas
通讯作者：
Kodadek, Thomas
影响因子：
3.9
作者：
Monchaud, D.;Allain, C.;Teulade-Fichou, M. -R
通讯作者：
Teulade-Fichou, M. -R
影响因子：
4.3
作者：
Pei, Renjun;Stojanovic, Milan N.
通讯作者：
Stojanovic, Milan N.