Genome2D: a visualization tool for the rapid analysis of bacterial transcriptome data.
Genome2D: a visualization tool for the rapid analysis of bacterial transcriptome data.
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DOI：
10.1186/gb-2004-5-5-r37
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发表时间：
2004
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Kuipers OP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Baerends RJ;Smits WK;de Jong A;Hamoen LW;Kok J;Kuipers OP
Genome2D是一种软件工具，使细菌转录组数据能够在染色体图谱上可视化。Genome2D是一个基于Windows的软件工具，用于在由注释的基因组序列构建的线性染色体图谱上可视化细菌转录组和定制数据集。Genome 2D通过使用不同的颜色范围来描绘基因组图谱上基因表达水平的差异，从而促进转录组数据的分析。这种输出格式使得能够目视检查转录组数据，并且将快速揭示转录单位，而无需表达水平截止值的先验知识。Genome2D的编译版本可供学术或非营利使用。
Genome2D is a software tool that enables bacterial transcriptome data to be visualized on chromosome maps. Genome2D is a Windows-based software tool for visualization of bacterial transcriptome and customized datasets on linear chromosome maps constructed from annotated genome sequences. Genome2D facilitates the analysis of transcriptome data by using different color ranges to depict differences in gene-expression levels on a genome map. Such output format enables visual inspection of the transcriptome data, and will quickly reveal transcriptional units, without prior knowledge of expression level cutoff values. The compiled version of Genome2D is freely available for academic or non-profit use from .
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