Characterization of the complete chloroplast genome sequence of Cecropia pachystachya.
Characterization of the complete chloroplast genome sequence of Cecropia pachystachya.
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Cecropia pachystachya 完整叶绿体基因组序列的表征
DOI：
10.1080/23802359.2017.1390420
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发表时间：
2017-10-17
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Li DZ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wu ZY;Du XY;Milne RI;Liu J;Li DZ
本研究测定了厚叶天牛的叶绿体全基因组。基因组全长153,925 ，包含一对25,443 的反向重复序列，分别由84,947 和18,092 的大单拷贝和小单拷贝分开。GC含量为36.5%。共有112个基因被注释，包括30个tRNA，4个rRNA和78个蛋白质编码基因。这是已知的天牛科Cecropia pachystachya cp基因组的首次报道，它证实了Cecropia pachystachya属于荨麻科。
The complete chloroplast genome of Cecropia pachystachya Trécul was determined in this study. The total genome size was 153,925 bp in length, containing a pair of inverted repeats (IRs) of 25,443 bp, which were separated by large single copy (LSC) and small single copy (SSC) of 84,947 bp and 18,092 bp, respectively. The GC contents is 36.5%. A total of 112 unique genes were annotated, including 30 tRNA, four rRNA, and 78 protein-coding genes. This is the first report of a cp genome for the formerly recognised family Cecropiaceae, and it confirmed that Cecropia pachystachya belongs within Urticaceae.
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作者：
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通讯作者：
Li DZ
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作者：
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通讯作者：
Quinn, Christopher J.
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作者：
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通讯作者：
Cai, Dao-Zhang
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作者：
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通讯作者：
Pevzner, Pavel A.
DOI：
10.1093/bioinformatics/bts199
发表时间：
2012-06-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Kearse M;Moir R;Wilson A;Stones-Havas S;Cheung M;Sturrock S;Buxton S;Cooper A;Markowitz S;Duran C;Thierer T;Ashton B;Meintjes P;Drummond A
通讯作者：
Drummond A