An objective comparison of cell-tracking algorithms.
An objective comparison of cell-tracking algorithms.
复制标题
细胞跟踪算法的客观比较。
DOI：
10.1038/nmeth.4473
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发表时间：
2017-12
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Ortiz-de-Solorzano C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ulman V;Maška M;Magnusson KEG;Ronneberger O;Haubold C;Harder N;Matula P;Matula P;Svoboda D;Radojevic M;Smal I;Rohr K;Jaldén J;Blau HM;Dzyubachyk O;Lelieveldt B;Xiao P;Li Y;Cho SY;Dufour AC;Olivo-Marin JC;Reyes-Aldasoro CC;Solis-Lemus JA;Bensch R;Brox T;Stegmaier J;Mikut R;Wolf S;Hamprecht FA;Esteves T;Quelhas P;Demirel Ö;Malmström L;Jug F;Tomancak P;Meijering E;Muñoz-Barrutia A;Kozubek M;Ortiz-de-Solorzano C
我们介绍了三个版本的细胞跟踪挑战的结果，这是一项旨在促进细胞跟踪算法的开发和客观评估的计划。模式，挑战显示了当今现场的最新状态。我们还根据生物学措施及其实际的可用性分析了所有算法的性能。在挑战中包括的分段和跟踪方案下，学习策略或分析全球空间视频环境中的细胞的表现更好。
We present a combined report on the results of three editions of the Cell Tracking Challenge, an ongoing initiative aimed at promoting the development and objective evaluation of cell tracking algorithms. With twenty-one participating algorithms and a data repository consisting of thirteen datasets of various microscopy modalities, the challenge displays today’s state of the art in the field. We analyze the results using performance measures for segmentation and tracking that rank all participating methods. We also analyze the performance of all algorithms in terms of biological measures and their practical usability. Even though some methods score high in all technical aspects, not a single one obtains fully correct solutions. We show that methods that either take prior information into account using learning strategies or analyze cells in a global spatio-temporal video context perform better than other methods under the segmentation and tracking scenarios included in the challenge.
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影响因子：
16.6
作者：
Cliffe A;Doupé DP;Sung H;Lim IK;Ong KH;Cheng L;Yu W
通讯作者：
Yu W
影响因子：
5.2
作者：
Lin, CL;Miller, JD
通讯作者：
Miller, JD
影响因子：
10.6
作者：
Magnusson KE;Jalden J;Gilbert PM;Blau HM
通讯作者：
Blau HM
细胞跟踪精度测量基于无环的图表的比较。
影响因子：
3.7
作者：
Matula P;Maška M;Sorokin DV;Matula P;Ortiz-de-Solórzano C;Kozubek M
通讯作者：
Kozubek M
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu080
发表时间：
2014-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Maška M;Ulman V;Svoboda D;Matula P;Matula P;Ederra C;Urbiola A;España T;Venkatesan S;Balak DM;Karas P;Bolcková T;Streitová M;Carthel C;Coraluppi S;Harder N;Rohr K;Magnusson KE;Jaldén J;Blau HM;Dzyubachyk O;Křížek P;Hagen GM;Pastor-Escuredo D;Jimenez-Carretero D;Ledesma-Carbayo MJ;Muñoz-Barrutia A;Meijering E;Kozubek M;Ortiz-de-Solorzano C
通讯作者：
Ortiz-de-Solorzano C