A novel G-quadruplex motif in the Human MET promoter region
A novel G-quadruplex motif in the Human MET promoter region
复制标题
人类 MET 启动子区域中的新型 G-四链体基序
DOI：
10.1042/bsr20171128
复制
发表时间：
2017-10
影响因子：
4
通讯作者：
Guan Yifu
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yan Jing;Zhao Deming;Dong Liping;Pan Shuang;Hao Fengjin;Guan Yifu
已知原癌基因启动子中富含鸟嘌呤的链可折叠成G -四链体结构以调控基因表达。在MET启动子中已鉴定出一种分子内平行G -四链体，它在调控MET表达中起抑制作用。然而，MET启动子中完整的富含鸟嘌呤区域在生理条件下形成一种混合平行/反平行G -四链体结构，这意味着该区域存在一些反平行以及混合平行/反平行G -四链体结构。在本研究中，我们的数据表明，g3 - 5截短体在体外生理条件下采用一种分子内混合平行/反平行G -四链体结构。g3 - 5 G -四链体结构在K⁺缓冲液中显著阻止Klenow片段的聚合。此外，圆二色性（CD）光谱和聚合酶终止试验的结果直接表明，g3 - 5片段中的G -四链体结构可被G -四链体配体TMPyP4（5,10,15,20 - 四-（N - 甲基- 4 - 吡啶基）卟啉）稳定。但是双荧光素酶试验表明TMPyP4对HepG2细胞中g3 - 5 G -四链体的形成没有影响。本研究的发现将丰富我们对原癌基因启动子中G -四链体形成以及基因表达调控机制的理解。
It is known that the guanine-rich strands in proto-oncogene promoters can fold into G-quadruplex structures to regulate gene expression. An intramolecular parallel G-quadruplex has been identified in MET promoter. It acts as a repressor in regulating MET expression. However, the full guanine-rich region in MET promoter forms a hybrid parallel/antiparallel G-quadruplex structure under physiological conditions, which means there are some antiparallel and hybrid parallel/antiparallel G-quadruplex structures in this region. In the present study, our data indicate that g3-5 truncation adopts an intramolecular hybrid parallel/antiparallel G-quadruplex under physiological conditions in vitro. The g3-5 G-quadruplex structure significantly stops polymerization by Klenow fragment in K+ buffer. Furthermore, the results of circular dichroism (CD) spectra and polymerase stop assay directly demonstrate that the G-quadruplex structure in g3-5 fragment can be stabilized by the G-quadruplex ligand TMPyP4 (5,10,15,20-tetra-(N-methyl-4-pyridyl) porphine). But the dual luciferase assay indicates TMPyP4 has no effect on the formation of g3-5 G-quadruplex in HepG2 cells. The findings in the present study will enrich our understanding of the G-quadruplex formation in proto-oncogene promoters and the mechanisms of gene expression regulation.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1158/aacr.edb-ccr-06-0818
发表时间：
2008-04
期刊：
Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
影响因子：
--
作者：
B. Peruzzi;D. Bottaro
通讯作者：
B. Peruzzi;D. Bottaro
人 MET 启动子区域形成的分子内 G-四链体结构及其生物学相关性。
影响因子：
4.6
作者：
Yan Jing;Zhao Xiaoyang;Liu Bo;Yuan Ying;Guan Yifu
通讯作者：
Guan Yifu
影响因子：
3.8
作者：
You WK;McDonald DM
通讯作者：
McDonald DM
DOI：
10.1007/978-3-030-15054-9_4
发表时间：
1902-05
期刊：
The Mathematical Gazette
影响因子：
--
作者：
M. Maksimovic;E. Omanovic-Miklicanin;A. Badnjević
通讯作者：
M. Maksimovic;E. Omanovic-Miklicanin;A. Badnjević
影响因子：
14.9
作者：
Sun D;Guo K;Rusche JJ;Hurley LH
通讯作者：
Hurley LH