Open source bioimage informatics for cell biology.
Open source bioimage informatics for cell biology.
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DOI：
10.1016/j.tcb.2009.08.007
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发表时间：
2009-11
影响因子：
19
通讯作者：
Eliceiri, Kevin W.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Swedlow, Jason R.;Eliceiri, Kevin W.
成像、分子生物学和基因组学的重大技术进步推动了细胞生物学的革命，因为细胞的分子和结构过程现在可以常规地可视化和测量。推动这一最新发展的大部分是用于这些数据集的获取、可视化、分析和传播的计算工具的出现。这些工具共同组成了计算生物学的一个新的子领域，称为生物图像信息学，这是由开源方法促进的。我们讨论了为什么在细胞生物学图像信息学的开源工具是必要的，是什么使一个开源的成像应用程序成功的一些关键的一般属性，并指出进一步的可操作性，应该大大加快未来的细胞生物学发现的机会。
Significant technical advances in imaging, molecular biology and genomics have fueled a revolution in cell biology, in that the molecular and structural processes of the cell are now visualized and measured routinely. Driving much of this recent development has been the advent of computational tools for the acquisition, visualization, analysis and dissemination of these datasets. These tools collectively make up a new subfield of computational biology called bioimage informatics, which is facilitated by open source approaches. We discuss why open source tools for image informatics in cell biology are needed, some of the key general attributes of what make an open source imaging application successful, and point to opportunities for further operability that should greatly accelerate future cell biology discovery.
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