CryoEM-based hybrid modeling approaches for structure determination.
CryoEM-based hybrid modeling approaches for structure determination.
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DOI：
10.1016/j.mib.2017.10.002
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发表时间：
2018-06
影响因子：
5.4
通讯作者：
Zhang P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cassidy CK;Himes BA;Luthey-Schulten Z;Zhang P
冷冻电子显微镜（cryoEM）的最新进展显着提高了玻璃化生物标本的研究分辨率，揭示了新的结构和机制的见解在广泛的空间尺度。在这些进步的支持下，许多努力已经转向开发混合建模方法，用于从cryoEM数据构建和改进高保真原子模型。在这篇简短的综述中，我们将调查基于cryoEM的混合建模的关键要素，概述可用的计算工具和策略以及最近的几个应用。
Recent advances in cryo-electron microscopy (cryoEM) have dramatically improved the resolutions at which vitrified biological specimens can be studied, revealing new structural and mechanistic insights over a broad range of spatial scales. Bolstered by these advances, much effort has been directed towards the development of hybrid modeling methodologies for the construction and refinement of high-fidelity atomistic models from cryoEM data. In this brief review, we will survey the key elements of cryoEM-based hybrid modeling, providing an overview of available computational tools and strategies as well as several recent applications.
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影响因子：
48
作者：
Barad BA;Echols N;Wang RY;Cheng Y;DiMaio F;Adams PD;Fraser JS
通讯作者：
Fraser JS
对称性EM图的对称弹性柔性拟合。
影响因子：
5.7
作者：
Chan, Kwok-Yan;Gumbart, James;McGreevy, Ryan;Watermeyer, Jean M.;Sewell, B. Trevor;Schulten, Klaus
通讯作者：
Schulten, Klaus
影响因子：
5.8
作者：
DiMaio, Frank;Kondrashov, Dmitry A.;Shavlik, Jude W.
通讯作者：
Shavlik, Jude W.
DOI：
10.1107/s0907444909052925
发表时间：
2010-02
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Adams PD;Afonine PV;Bunkóczi G;Chen VB;Davis IW;Echols N;Headd JJ;Hung LW;Kapral GJ;Grosse-Kunstleve RW;McCoy AJ;Moriarty NW;Oeffner R;Read RJ;Richardson DC;Richardson JS;Terwilliger TC;Zwart PH
通讯作者：
Zwart PH
影响因子：
48
作者：
de la Cruz MJ;Hattne J;Shi D;Seidler P;Rodriguez J;Reyes FE;Sawaya MR;Cascio D;Weiss SC;Kim SK;Hinck CS;Hinck AP;Calero G;Eisenberg D;Gonen T
通讯作者：
Gonen T