TB database: an integrated platform for tuberculosis research.
TB database: an integrated platform for tuberculosis research.
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DOI：
10.1093/nar/gkn652
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发表时间：
2009-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Schoolnik GK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Reddy TB;Riley R;Wymore F;Montgomery P;DeCaprio D;Engels R;Gellesch M;Hubble J;Jen D;Jin H;Koehrsen M;Larson L;Mao M;Nitzberg M;Sisk P;Stolte C;Weiner B;White J;Zachariah ZK;Sherlock G;Galagan JE;Ball CA;Schoolnik GK
由于需要长期、复杂且具有潜在毒性的药物治疗方案、对低效疫苗的依赖以及缺乏临床状态生物标志物，结核病 (TB) 的有效控制受到阻碍。基因组学时代对结核病控制的希望是巨大的，但由于缺乏一个中央存储库而受到阻碍，该存储库以易于访问和分析的方式收集和整合有关该生物体的基因组和实验数据。结核病数据库 (TBDB) 是一个综合数据库，提供与结核病药物、疫苗和生物标志物的发现和开发相关的结核病基因组数据和资源。当前版本的 TBDB 包含 28 种不同结核分枝杆菌菌株和相关细菌的基因组序列数据和注释。 TBDB 存储结核分枝杆菌及其近亲的发表前和发表后的基因表达数据。 TBDB 目前拥有近 1500 个公共结核病微阵列和 260 个链霉菌阵列的数据。此外，TBDB 还提供了一套比较基因组学和微阵列分析软件。通过将结核分枝杆菌基因组注释和基因表达数据与一套分析工具结合在一起，TBDB (http://www.tbdb.org/) 为结核病研究提供了一个独特的发现平台。
The effective control of tuberculosis (TB) has been thwarted by the need for prolonged, complex and potentially toxic drug regimens, by reliance on an inefficient vaccine and by the absence of biomarkers of clinical status. The promise of the genomics era for TB control is substantial, but has been hindered by the lack of a central repository that collects and integrates genomic and experimental data about this organism in a way that can be readily accessed and analyzed. The Tuberculosis Database (TBDB) is an integrated database providing access to TB genomic data and resources, relevant to the discovery and development of TB drugs, vaccines and biomarkers. The current release of TBDB houses genome sequence data and annotations for 28 different Mycobacterium tuberculosis strains and related bacteria. TBDB stores pre- and post-publication gene-expression data from M. tuberculosis and its close relatives. TBDB currently hosts data for nearly 1500 public tuberculosis microarrays and 260 arrays for Streptomyces. In addition, TBDB provides access to a suite of comparative genomics and microarray analysis software. By bringing together M. tuberculosis genome annotation and gene-expression data with a suite of analysis tools, TBDB (http://www.tbdb.org/) provides a unique discovery platform for TB research.
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作者：
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通讯作者：
Ball, Catherine A.
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通讯作者：
Bateman, Alex
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通讯作者：
Schoolnik, GK
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发表时间：
2000-08-29
影响因子：
11.1
作者：
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通讯作者：
Botstein, D
DOI：
10.1016/j.ddmec.2007.11.003
发表时间：
2007-01-01
期刊：
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影响因子：
--
作者：
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通讯作者：
Hawn, Thomas R