How community has shaped the Protein Data Bank.
How community has shaped the Protein Data Bank.
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DOI：
10.1016/j.str.2013.07.010
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发表时间：
2013-09-03
期刊：
影响因子：
5.7
通讯作者：
Markley, John L.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Berman, Helen M.;Kleywegt, Gerard J.;Nakamura, Haruki;Markley, John L.
经过几年的社区讨论，蛋白质数据库（PDB）于1971年成立，作为生物大分子三维模型坐标的公共存储库。从那时起，结构模型的数量、规模和复杂性持续增长，反映了结构生物学的生产力。PDB由Worldwide PDB组织管理，能够满足对结构信息数量和质量日益增长的需求。除了提供对结构信息的无限制访问外，PDB还致力于促进数据标准，并在更广泛的受众中提高结构生物学的知名度。从这个角度来看，我们描述了PDB的历史和社区继续塑造档案的许多方式。
Following several years of community discussion, the Protein Data Bank (PDB) was established in 1971 as a public repository for the coordinates of three-dimensional models of biological macromolecules. Since then, the number, size, and complexity of structural models have continued to grow, reflecting the productivity of structural biology. Managed by the Worldwide PDB organization, the PDB has been able to meet increasing demands for the quantity of structural information and of quality. In addition to providing unrestricted access to structural information, the PDB also works to promote data standards and to raise the profile of structural biology with broader audiences. In this perspective, we describe the history of PDB and the many ways in which the community continues to shape the archive.
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DOI：
10.1107/s0907444913001157
发表时间：
2013-05
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Gutmanas A;Oldfield TJ;Patwardhan A;Sen S;Velankar S;Kleywegt GJ
通讯作者：
Kleywegt GJ
影响因子：
14.9
作者：
Kinjo AR;Suzuki H;Yamashita R;Ikegawa Y;Kudou T;Igarashi R;Kengaku Y;Cho H;Standley DM;Nakagawa A;Nakamura H
通讯作者：
Nakamura H
DOI：
10.1107/s0108767307035623
发表时间：
2008-01-01
影响因子：
1.8
作者：
Berman, Helen M.
通讯作者：
Berman, Helen M.
DOI：
10.1107/s0907444902016657
发表时间：
2002-11-01
影响因子：
2.2
作者：
Adams, PD;Grosse-Kunstleve, RW;Terwilliger, TC
通讯作者：
Terwilliger, TC
DOI：
10.1107/s0907444911050359
发表时间：
2012-04
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Gore S;Velankar S;Kleywegt GJ
通讯作者：
Kleywegt GJ