Bioinformatics challenges and perspectives when studying the effect of epigenetic modifications on alternative splicing.
Bioinformatics challenges and perspectives when studying the effect of epigenetic modifications on alternative splicing.
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DOI：
10.1098/rstb.2017.0073
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发表时间：
2018-06-05
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Koziol MJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Pacini C;Koziol MJ
众所周知，表观遗传修饰在转录调控中是重要的，但也有几个报告在选择性剪接中。剪接调控对于解释蛋白质组的多样性具有重要意义，剪接调控失调与许多疾病有关。在这里，我们简要概述了表观遗传学在选择性剪接和疾病中的作用。然后我们讨论了生物信息学方法，可以用来模拟表观遗传标记和剪接调控因子之间的相互作用。这些模型可以用来识别不同表型之间的选择性剪接和表观遗传变化。这篇文章是“表观遗传化学生物学的前沿”讨论会的一部分。
It is widely known that epigenetic modifications are important in regulating transcription, but several have also been reported in alternative splicing. The regulation of pre-mRNA splicing is important to explain proteomic diversity and the misregulation of splicing has been implicated in many diseases. Here, we give a brief overview of the role of epigenetics in alternative splicing and disease. We then discuss the bioinformatics methods that can be used to model interactions between epigenetic marks and regulators of splicing. These models can be used to identify alternative splicing and epigenetic changes across different phenotypes. This article is part of a discussion meeting issue ‘Frontiers in epigenetic chemical biology’.
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N6-甲基脱氧腺苷标记了衣原体中的主动转录起始位点。
影响因子：
64.5
作者：
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通讯作者：
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48
作者：
Flusberg, Benjamin A.;Webster, Dale R.;Lee, Jessica H.;Travers, Kevin J.;Olivares, Eric C.;Clark, Tyson A.;Korlach, Jonas;Turner, Stephen W.
通讯作者：
Turner, Stephen W.
DOI：
10.1038/nrm.2017.27
发表时间：
2017-07
期刊：
Nature reviews. Molecular cell biology
影响因子：
--
作者：
Baralle FE;Giudice J
通讯作者：
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影响因子：
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作者：
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通讯作者：
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MeCP2 通过大脑中的表观遗传修饰调节 mRNA 剪接。
影响因子：
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作者：
Cheng TL;Chen J;Wan H;Tang B;Tian W;Liao L;Qiu Z
通讯作者：
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