PDBe: Protein Data Bank in Europe.
PDBe: Protein Data Bank in Europe.
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DOI：
10.1093/nar/gkp916
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kleywegt GJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Velankar S;Best C;Beuth B;Boutselakis CH;Cobley N;Sousa Da Silva AW;Dimitropoulos D;Golovin A;Hirshberg M;John M;Krissinel EB;Newman R;Oldfield T;Pajon A;Penkett CJ;Pineda-Castillo J;Sahni G;Sen S;Slowley R;Suarez-Uruena A;Swaminathan J;van Ginkel G;Vranken WF;Henrick K;Kleywegt GJ
欧洲蛋白质数据库（PDBe）（http：//www.ebi.ac.uk/pdbe/）正在积极与其全球蛋白质数据库合作伙伴合作，以提高生物大分子结构数据国际档案馆-蛋白质数据库（PDB）的质量和一致性。PDBe还与欧洲生物信息学研究所和世界各地科学界的合作者密切合作，通过向PDB中现有的结构数据添加策划和积极维护的衍生数据来增强其数据库和服务。我们已经开发了一个新的数据库基础设施的基础上修复PDB档案数据和专门设计的数据库存储信息的蛋白质和结合分子之间的相互作用。该小组开发了新的服务，允许用户执行简单的文本查询或更复杂的基于3D结构的查询。新设计的“PDBeView图集页”以方便用户的格式提供了一个PDB条目的概览，并作为进一步探索PDBe数据库中现有信息的起点。PDBe积极参与X射线晶体学、核磁共振光谱学和低温电子显微镜领域的工作，改进了结构沉积和分析工具。
The Protein Data Bank in Europe (PDBe) (http://www.ebi.ac.uk/pdbe/) is actively working with its Worldwide Protein Data Bank partners to enhance the quality and consistency of the international archive of bio-macromolecular structure data, the Protein Data Bank (PDB). PDBe also works closely with its collaborators at the European Bioinformatics Institute and the scientific community around the world to enhance its databases and services by adding curated and actively maintained derived data to the existing structural data in the PDB. We have developed a new database infrastructure based on the remediated PDB archive data and a specially designed database for storing information on interactions between proteins and bound molecules. The group has developed new services that allow users to carry out simple textual queries or more complex 3D structure-based queries. The newly designed ‘PDBeView Atlas pages’ provide an overview of an individual PDB entry in a user-friendly layout and serve as a starting point to further explore the information available in the PDBe database. PDBe’s active involvement with the X-ray crystallography, Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy and cryo-Electron Microscopy communities have resulted in improved tools for structure deposition and analysis.
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影响因子：
3
作者：
Henrick, K;Newman, R;Chagoyen, M
通讯作者：
Chagoyen, M
影响因子：
2.7
作者：
Doreleijers JF;Vranken WF;Schulte C;Lin J;Wedell JR;Penkett CJ;Vuister GW;Vriend G;Markley JL;Ulrich EL
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Ulrich EL
影响因子：
14.9
作者：
UniProt Consortium
通讯作者：
UniProt Consortium
影响因子：
14.9
作者：
Hulo N;Bairoch A;Bulliard V;Cerutti L;Cuche BA;de Castro E;Lachaize C;Langendijk-Genevaux PS;Sigrist CJ
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Sigrist CJ
影响因子：
3
作者：
Golovin A;Henrick K
通讯作者：
Henrick K