Importing ArrayExpress datasets into R/Bioconductor.
Importing ArrayExpress datasets into R/Bioconductor.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btp354
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发表时间：
2009-08-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Huber W
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kauffmann A;Rayner TF;Parkinson H;Kapushesky M;Lukk M;Brazma A;Huber W
摘要：ArrayExpress是微阵列数据集的最大公共存储库之一。 R/Bioconductor提供了一套综合的微阵列分析和综合生物信息学软件。但是，缺乏将数据集导入到r/bioconductor中的简单方法。在这里，我们提供了适合交互式和自动化的工具。
可用性：可从http://www.bioconductor.org的bioconductor项目获得阵列exprese软件包。包装提供了用户指南和示例。
联系人：audrey@ebi.ac.uk
补充信息：补充数据可在线提供生物信息学。
Summary:ArrayExpress is one of the largest public repositories of microarray datasets. R/Bioconductor provides a comprehensive suite of microarray analysis and integrative bioinformatics software. However, easy ways for importing datasets from ArrayExpress into R/Bioconductor have been lacking. Here, we present such a tool that is suitable for both interactive and automated use. Availability: The ArrayExpress package is available from the Bioconductor project at http://www.bioconductor.org. A users guide and examples are provided with the package. Contact: audrey@ebi.ac.uk Supplementary information:Supplementary data are available Bioinformatics online.
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影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
影响因子：
14.9
作者：
Parkinson H;Kapushesky M;Kolesnikov N;Rustici G;Shojatalab M;Abeygunawardena N;Berube H;Dylag M;Emam I;Farne A;Holloway E;Lukk M;Malone J;Mani R;Pilicheva E;Rayner TF;Rezwan F;Sharma A;Williams E;Bradley XZ;Adamusiak T;Brandizi M;Burdett T;Coulson R;Krestyaninova M;Kurnosov P;Maguire E;Neogi SG;Rocca-Serra P;Sansone SA;Sklyar N;Zhao M;Sarkans U;Brazma A
通讯作者：
Brazma A
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp354
发表时间：
2009-08-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Kauffmann A;Rayner TF;Parkinson H;Kapushesky M;Lukk M;Brazma A;Huber W
通讯作者：
Huber W
影响因子：
5.8
作者：
Sean, Davis;Meltzer, Paul S.
通讯作者：
Meltzer, Paul S.
影响因子：
5.8
作者：
Durinck, S;Allemeersch, J;De Moor, B
通讯作者：
De Moor, B