Holarctic genetic structure and range dynamics in the woolly mammoth.
Holarctic genetic structure and range dynamics in the woolly mammoth.
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DOI：
10.1098/rspb.2013.1910
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发表时间：
2013-11-07
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Thomas JA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Palkopoulou E;Dalén L;Lister AM;Vartanyan S;Sablin M;Sher A;Edmark VN;Brandström MD;Germonpré M;Barnes I;Thomas JA
古DNA分析提供了增强分辨率的人口历史在许多更新世类群。然而，大多数研究都受到空间的限制，使得物种水平的地理历史难以推断。在这里，我们分析线粒体DNA（mtDNA）的变化，在羊毛猛犸从其泛北极范围重建其历史在过去的20万年（Kyr）。我们确定了一个以前没有记录的主要mtDNA谱系在欧洲，这是由另一个主要mtDNA谱系32-34 kyr前（BP）。聚结模拟提供了支持人口扩张在约121 kyr BP，这表明，以前的间冰期是一个重要的驱动力，人口和种内遗传分化。此外，我们的研究结果表明，从美国到欧亚大陆的扩张约66 kyr BP，与白令陆桥在晚更新世的第一次曝光。贝叶斯推断表明，晚更新世的人口稳定，直到20-15万年BP，当一个严重的人口规模下降发生。
Ancient DNA analyses have provided enhanced resolution of population histories in many Pleistocene taxa. However, most studies are spatially restricted, making inference of species-level biogeographic histories difficult. Here, we analyse mitochondrial DNA (mtDNA) variation in the woolly mammoth from across its Holarctic range to reconstruct its history over the last 200 thousand years (kyr). We identify a previously undocumented major mtDNA lineage in Europe, which was replaced by another major mtDNA lineage 32–34 kyr before present (BP). Coalescent simulations provide support for demographic expansions at approximately 121 kyr BP, suggesting that the previous interglacial was an important driver for demography and intraspecific genetic divergence. Furthermore, our results suggest an expansion into Eurasia from America around 66 kyr BP, coinciding with the first exposure of the Bering Land Bridge during the Late Pleistocene. Bayesian inference indicates Late Pleistocene demographic stability until 20–15 kyr BP, when a severe population size decline occurred.
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DOI：
10.1016/j.cub.2011.05.058
发表时间：
2011-08-09
期刊：
Current biology : CB
影响因子：
--
作者：
Edwards CJ;Suchard MA;Lemey P;Welch JJ;Barnes I;Fulton TL;Barnett R;O'Connell TC;Coxon P;Monaghan N;Valdiosera CE;Lorenzen ED;Willerslev E;Baryshnikov GF;Rambaut A;Thomas MG;Bradley DG;Shapiro B
通讯作者：
Shapiro B
DOI：
10.1111/j.1095-8312.2005.00415.x
发表时间：
2005-01-01
影响因子：
1.9
作者：
Dalén, L;Fuglei, E;Angerbjörn, A
通讯作者：
Angerbjörn, A
影响因子：
56.9
作者：
Gilbert, M. Thomas P.;Tomsho, Lynn P.;Schuster, Stephan C.
通讯作者：
Schuster, Stephan C.
影响因子：
9.2
作者：
Debruyne, Regis;Chu, Genevieve;Poinar, Hendrik N.
通讯作者：
Poinar, Hendrik N.
影响因子：
7.7
作者：
Excoffier, Laurent;Lischer, Heidi E. L.
通讯作者：
Lischer, Heidi E. L.