RNAcentral: a comprehensive database of non-coding RNA sequences.
RNAcentral: a comprehensive database of non-coding RNA sequences.
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DOI：
10.1093/nar/gkw1008
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发表时间：
2017-01-04
影响因子：
14.9
通讯作者：
Dinger ME
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
The RNAcentral Consortium;Petrov AI;Kay SJE;Kalvari I;Howe KL;Gray KA;Bruford EA;Kersey PJ;Cochrane G;Finn RD;Bateman A;Kozomara A;Griffiths-Jones S;Frankish A;Zwieb CW;Lau BY;Williams KP;Chan PP;Lowe TM;Cannone JJ;Gutell R;Machnicka MA;Bujnicki JM;Yoshihama M;Kenmochi N;Chai B;Cole JR;Szymanski M;Karlowski WM;Wood V;Huala E;Berardini TZ;Zhao Y;Chen R;Zhu W;Paraskevopoulou MD;Vlachos IS;Hatzigeorgiou AG;Ma L;Zhang Z;Puetz J;Stadler PF;McDonald D;Basu S;Fey P;Engel SR;Cherry JM;Volders PJ;Mestdagh P;Wower J;Clark MB;Quek XC;Dinger ME
rnacentral是一个非编码RNA（NCRNA）序列的数据库，该数据库汇总了来自专用NCRNA资源的数据，并提供了一个单个入口点，用于访问所有生物体中所有NCRNA类型的NCRNA序列。自2014年推出以来，rnacentral已将12个新资源集成了12个新资源，将协作数据库的总数归为22，并开始导入新类型的数据，例如Modomics和PDB的修改核苷酸。我们创建了新的物种特异性标识符，这些标识符指的是在单个物种的背景下独特的RNA序列。该网站一直受到持续改进，重点是文本和序列相似性搜索以及基因组浏览功能。所有rnacentral数据均可免费提供，可在http://rnacentral.org/上免费浏览，批量下载和程序化访问。
RNAcentral is a database of non-coding RNA (ncRNA) sequences that aggregates data from specialised ncRNA resources and provides a single entry point for accessing ncRNA sequences of all ncRNA types from all organisms. Since its launch in 2014, RNAcentral has integrated twelve new resources, taking the total number of collaborating database to 22, and began importing new types of data, such as modified nucleotides from MODOMICS and PDB. We created new species-specific identifiers that refer to unique RNA sequences within a context of single species. The website has been subject to continuous improvements focusing on text and sequence similarity searches as well as genome browsing functionality. All RNAcentral data is provided for free and is available for browsing, bulk downloads, and programmatic access at http://rnacentral.org/.
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