Coordinated repression of pro-differentiation genes via P-bodies and transcription maintains Drosophila intestinal stem cell identity.
Coordinated repression of pro-differentiation genes via P-bodies and transcription maintains Drosophila intestinal stem cell identity.
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DOI：
10.1016/j.cub.2021.11.032
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发表时间：
2022-01-24
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Sokol NS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Buddika K;Huang YT;Ariyapala IS;Butrum-Griffith A;Norrell SA;O'Connor AM;Patel VK;Rector SA;Slovan M;Sokolowski M;Kato Y;Nakamura A;Sokol NS
加工体（P 体）是成体干细胞中转录后控制的关键位点，其作用仍然知之甚少。在此，我们报道成年果蝇肠干细胞（但不包括吸收性肠上皮细胞（EC）等分化细胞周围的细胞）含有含有哺乳动物 P 体成分 DDX6、EDC3、EDC4 和 LSM14A/B 的果蝇直系同源物的 P 体。肠道祖细胞中的靶向 RNAi 筛选鉴定出 39 种先前已知的和 64 种新型 P 体调节因子，其中包括 Patr-1（一种 P 体组装所需的基因）。 Patr-1 依赖性 P 体的丢失会导致干细胞的丢失，这与 EC 命运基因 nubbin 的不当表达有关。祖细胞的转录组学分析鉴定出这种弱转录的促分化转录本的核心，这些转录本在 P 体丢失后升高。总而言之，这项研究确定了一种 P 体依赖性抑制活性，它与已知的转录抑制程序相协调，以维持体内干细胞群体处于准备分化的状态。干细胞如何在成体组织中维持是一个基本问题。 Buddika 等人在一项新研究中表明，果蝇肠干细胞含有 P 体，可抑制弱转录的促分化基因的表达，从而抑制早熟分化，从而确保该细胞的维持。
The role of Processing bodies (P-bodies), key sites of post-transcriptional control, in adult stem cells remains poorly understood. Here, we report that adult Drosophila intestinal stem cells, but not surrounding differentiated cells such as absorptive Enterocytes (ECs), harbor P-bodies that contain Drosophila orthologs of mammalian P-body components DDX6, EDC3, EDC4 and LSM14A/B. A targeted RNAi screen in intestinal progenitor cells identified 39 previously known and 64 novel P-body regulators, including Patr-1, a gene necessary for P-body assembly. Loss of Patr-1-dependent P-bodies leads to a loss of stem cells that is associated with inappropriate expression of EC-fate gene nubbin. Transcriptomic analysis of progenitor cells identifies a cadre of such weakly transcribed pro-differentiation transcripts that are elevated after P-body loss. Altogether, this study identifies a P-body-dependent repression activity that coordinates with known transcriptional repression programs to maintain a population of in vivo stem cells in a state primed for differentiation. How stem cells are maintained in adult tissues is a fundamental question. In a new study, Buddika et al., show that Drosophila intestinal stem cells contain P-bodies that repress the expression of weakly transcribed pro-differentiation genes to repress precocious differentiation and thereby ensure the maintenance of this cell.
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影响因子：
3.7
作者：
Fan SJ;Marchand V;Ephrussi A
通讯作者：
Ephrussi A
DOI：
10.15252/embj.201591517
发表时间：
2015-08-04
期刊：
The EMBO journal
影响因子：
--
作者：
Antonello ZA;Reiff T;Ballesta-Illan E;Dominguez M
通讯作者：
Dominguez M
影响因子：
16.2
作者：
Barbee, Scott A.;Estes, Patricia S.;Ramaswami, Mani
通讯作者：
Ramaswami, Mani
mRNA 脱帽和 P 体形成的控制。
影响因子：
16
作者：
Franks, Tobias M.;Lykke-Andersen, Jens
通讯作者：
Lykke-Andersen, Jens
影响因子：
4.6
作者：
Chen, Ching-Huan;Luhur, Arthur;Sokol, Nicholas
通讯作者：
Sokol, Nicholas