Strain identification of Actinobacillus actinomycetemcomitans using the polymerase chain reaction.
Strain identification of Actinobacillus actinomycetemcomitans using the polymerase chain reaction.
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使用聚合酶链反应鉴定放线放线杆菌的菌株。
DOI：
10.1111/j.1399-302x.1992.tb00032.x
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发表时间：
1992
影响因子：
--
通讯作者：
Fuerst,PA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Griffen,AL;Leys,EJ;Fuerst,PA
通过鉴定16S和23S核糖体基因之间高度可变的转录间隔区中的DNA限制性位点多态性，开发了一种区分牙周致病菌伴放线放线杆菌菌株的分子测定法。使用16S和23S基因的保守区域内的引物，使用聚合酶链反应（PCR）从基因组DNA扩增该区域。使用一系列限制性内切酶消化该扩增区域并进行酶切。通过RsaI和NciI分别消化获得的限制性片段长度多态性检查允许将检查的7个菌株分为4个遗传组。该方法提供了一种比全基因组方法更精确和重复性更好的菌株鉴定方法，可作为研究A.放线菌共生菌株。检测到的遗传变异性提供了强有力的证据，表明该地区的直接序列分析可以提供非常精确和潜在的确定性菌株鉴定。
A molecular assay that distinguishes among strains of the periodontal pathogenActinobacillus actinomycetemcomitanswas developed by identifying DNA restriction site polymorphisms in the highly variable transcribed spacer region between the 16S and 23S ribosomal genes. The polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify this region from genomic DNA using primers within conserved regions of the 16S and 23S genes. This amplified region was digested using a series of restriction enzymes and electrophoresed. Examination of restriction fragment length polymorphisms obtained by separate digestion with RsaI and NciI allowed the 7 strains examined to be divided into 4 genetic groups. This assay provides a more precise and reproducible method of strain identification than whole genomic methods and should be useful as a method for studying the epidemiology ofA. actinomycetemcomitansstrains in human subjects. The genetic variability detected supplies strong evidence that direct sequence analysis of the region could provide extremely precise and potentially definitive identification of strains.
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