HeatMapper: powerful combined visualization of gene expression profile correlations, genotypes, phenotypes and sample characteristics.
HeatMapper: powerful combined visualization of gene expression profile correlations, genotypes, phenotypes and sample characteristics.
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DOI：
10.1186/1471-2105-7-337
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发表时间：
2006-07-12
影响因子：
3
通讯作者：
Valk, Peter J. M.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Verhaak, Roel G. W.;Sanders, Mathijs A.;Bijl, Maarten A.;Delwel, Ruud;Horsman, Sebastiaan;Moorhouse, Michael J.;van der Spek, Peter J.;Lowenberg, Bob;Valk, Peter J. M.
目前，经常通过直观地结合样本基因热图和样本特征来准确解释大规模表达谱研究的无监督分析所获得的数据。该方法对于比较单个样本或样本组来说并不是最佳的。在这里，我们描述了一种使用相关图和附加样本元数据来直观地集成无监督和监督聚类分析结果的方法。我们开发了一种名为 HeatMapper 的工具，它以动态且灵活的方式提供此类可视化，并且可以从 . HeatMapper 可以对基因表达谱和聚类分析的结果进行可访问且全面的可视化。
Accurate interpretation of data obtained by unsupervised analysis of large scale expression profiling studies is currently frequently performed by visually combining sample-gene heatmaps and sample characteristics. This method is not optimal for comparing individual samples or groups of samples. Here, we describe an approach to visually integrate the results of unsupervised and supervised cluster analysis using a correlation plot and additional sample metadata. We have developed a tool called the HeatMapper that provides such visualizations in a dynamic and flexible manner and is available from . The HeatMapper allows an accessible and comprehensive visualization of the results of gene expression profiling and cluster analysis.
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