Writ large: Genomic dissection of the effect of cellular environment on immune response.
Writ large: Genomic dissection of the effect of cellular environment on immune response.
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DOI：
10.1126/science.aaf5453
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发表时间：
2016-10-07
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Regev A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yosef N;Regev A
免疫系统的细胞通常对来自其局部环境的线索作出反应，并通过瞬时反应、分化轨迹的选择、细胞状态的可塑性变化以及对其居住组织的可塑性适应来反馈到其周围环境。基因组学方法为全面研究这种精心策划的反应开辟了道路。专注于转录和表观遗传细胞状态的基因组分析，我们讨论了它们如何应用于研究面临各种环境线索的免疫细胞。我们强调了一些新兴的原则，密集的调控电路，表观遗传记忆，细胞类型的流动性，并重复使用的监管模块的作用，在实现和保持适当的反应不断变化的环境。这为系统地了解复杂组织中的分子回路迈出了第一步。
Cells of the immune system routinely respond to cues from their local environment and feedback to their surrounding through transient responses, choice of differentiation trajectories, plastic changes in cell state, and malleable adaptation to their tissue of residence. Genomic approaches have opened the way for comprehensive interrogation of such orchestrated responses. Focusing on genomic profiling of transcriptional and epigenetic cell state, we discuss how they are applied to investigate immune cells faced with various environmental cues. We highlight some of the emerging principles, on the role of dense regulatory circuitry, epigenetic memory, cell type fluidity, and reuse of regulatory modules, in achieving and maintaining appropriate responses to a changing environment. These provide a first step toward a systematic understanding of molecular circuits in complex tissues.
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DOI：
10.1126/science.1247651
发表时间：
2014-02-14
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Jaitin DA;Kenigsberg E;Keren-Shaul H;Elefant N;Paul F;Zaretsky I;Mildner A;Cohen N;Jung S;Tanay A;Amit I
通讯作者：
Amit I
控制FOXP3基因座中的顺式元素对调节T细胞身份的遗传控制。
影响因子：
64.5
作者：
Feng Y;Arvey A;Chinen T;van der Veeken J;Gasteiger G;Rudensky AY
通讯作者：
Rudensky AY
影响因子：
--
作者：
Bonelli, Michael;Shih, Han-Yu;Hirahara, Kiyoshi;Singelton, Kentner;Laurence, Arian;Poholek, Amanda;Hand, Tim;Mikami, Yohei;Vahedi, Golnaz;Kanno, Yuka;O'Shea, John J.
通讯作者：
O'Shea, John J.
DOI：
10.1126/science.1179050
发表时间：
2009-10-09
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Amit I;Garber M;Chevrier N;Leite AP;Donner Y;Eisenhaure T;Guttman M;Grenier JK;Li W;Zuk O;Schubert LA;Birditt B;Shay T;Goren A;Zhang X;Smith Z;Deering R;McDonald RC;Cabili M;Bernstein BE;Rinn JL;Meissner A;Root DE;Hacohen N;Regev A
通讯作者：
Regev A
影响因子：
30.5
作者：
通讯作者：
--