Predicting potential miRNA target sites within gene promoters.
Predicting potential miRNA target sites within gene promoters.
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DOI：
10.1016/j.bmcl.2009.04.032
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发表时间：
2009-07-15
影响因子：
2.7
通讯作者：
Corey DR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Younger ST;Pertsemlidis A;Corey DR
合成的与基因启动子互补的小双工rna可以激活或抑制靶基因的表达。这些rna调控基因的效力和稳健性表明，可能存在促进内源性小rna识别基因启动子序列的自然机制。在这里，我们描述了用于识别基因启动子内潜在miRNA靶点的计算方法。这些方法将有助于研究mirna是否与3 '非翻译区外的序列相互作用，并为设计合成基因表达调节剂提供新的靶点。
Synthetic small duplex RNAs that are complementary to gene promoters can activate or inhibit target gene expression. The potency and robustness of gene modulation by these RNAs suggests that natural mechanisms may exist to facilitate recognition of sequences within gene promoters by endogenous small RNAs. Here we describe computational methods for identifying potential miRNA target sites within gene promoters. These methods will facilitate investigations of whether miRNAs interact with sequences outside of 3′ untranslated regions and suggest new targets for the design of synthetic modulators of gene expression.
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DOI：
10.1073/pnas.0808830105
发表时间：
2008-10-21
影响因子：
11.1
作者：
Kim, Daniel H.;Saetrom, Pal;Rossi, John J.
通讯作者：
Rossi, John J.
影响因子：
56.9
作者：
Lagos-Quintana, M;Rauhut, R;Tuschl, T
通讯作者：
Tuschl, T
影响因子：
14.9
作者：
Griffiths-Jones, S
通讯作者：
Griffiths-Jones, S
DOI：
10.1073/pnas.0707594105
发表时间：
2008-02-05
影响因子：
11.1
作者：
Place, Robert F.;Li, Long-Cheng;Dahiya, Rajvir
通讯作者：
Dahiya, Rajvir
Mirbase：MicroRNA基因组学的工具。
影响因子：
14.9
作者：
Griffiths-Jones, Sam;Saini, Harpreet Kaur;van Dongen, Stijn;Enright, Anton J.
通讯作者：
Enright, Anton J.