Textpresso for neuroscience: searching the full text of thousands of neuroscience research papers.
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DOI：
10.1007/s12021-008-9031-0
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发表时间：
2008-09
期刊：
影响因子：
3
通讯作者：
Sternberg, Paul W.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mueller, Hans-Michael;Rangarajan, Arun;Teal, Tracy K.;Sternberg, Paul W.
关键词：
TextData是一个面向科学文献的文本挖掘系统。它的两个主要特点是可以获得研究论文的全文，以及开发和使用生物概念的类别以及描述或涉及对象的类别。搜索引擎使用户能够在整个文献中搜索这些类别和/或关键词中的一个或组合。在这里，我们描述了神经科学的文本，核心神经科学信息框架（NIF）的一部分。目前，该网站有67，500篇论文全文和131，300篇摘要。我们表明，在文献中使用类别可以使一个纯粹的关键字查询更精致和有意义。我们还展示了如何语义查询可以制定类别。我们解释了数据库的构建和内容，并描述了网页的主要功能和高级搜索选项。我们还详细说明了开发的Web服务，以提供编程访问TextData。NIF接口使用此Web服务访问TextData。神经科学教科书的独立网站可以在http://www.textpresso.org/neuroscience/上访问。
Textpresso is a text-mining system for scientific literature. Its two major features are access to the full text of research papers and the development and use of categories of biological concepts as well as categories that describe or relate objects. A search engine enables the user to search for one or a combination of these categories and/or keywords within an entire literature. Here we describe Textpresso for Neuroscience, part of the core Neuroscience Information Framework (NIF). The Textpresso site currently consists of 67,500 full text papers and 131,300 abstracts. We show that using categories in literature can make a pure keyword query more refined and meaningful. We also show how semantic queries can be formulated with categories only. We explain the build and content of the database and describe the main features of the web pages and the advanced search options. We also give detailed illustrations of the web service developed to provide programmatic access to Textpresso. This web service is used by the NIF interface to access Textpresso. The standalone website of Textpresso for Neuroscience can be accessed at http://www.textpresso.org/neuroscience/.
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作者：
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作者：
Gene Ontology Consortium
通讯作者：
Gene Ontology Consortium