Utilizing glycoside hydrolases to improve the quantitation and visualization of biofilm bacteria.
Utilizing glycoside hydrolases to improve the quantitation and visualization of biofilm bacteria.
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DOI：
10.1016/j.bioflm.2020.100037
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发表时间：
2020-12
期刊：
影响因子：
6.8
通讯作者：
Rumbaugh KP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fleming D;Redman W;Welch GS;Mdluli NV;Rouchon CN;Frank KL;Rumbaugh KP
微生物生物膜的复杂性对微生物研究的传统方法提出了一些挑战。特别是，很难准确计算生物膜细菌的数量，因为即使经过彻底的均质或超声处理，仍会留下小块生物膜，其中含有大量细菌细胞，导致不准确的低菌落形成单位（CFU）。此外，在体外对感染组织进行成像时，通常会导致CFU与显微镜下观察到的细菌细胞数量存在差异。我们假设这种现象是由于生物膜细胞外聚合物质降低了染色剂和抗体对嵌入细菌细胞的可及性。在这项研究中，我们描述了将eps降解糖苷水解酶用于CFU测定，以获得更准确的活细胞估计，并通过免疫组织化学破坏生物膜基质并增加与细菌细胞结合的一抗。
The complexity of microbial biofilms offers several challenges to the use of traditional means of microbial research. In particular, it can be difficult to calculate accurate numbers of biofilm bacteria, because even after thorough homogenization or sonication, small pieces of the biofilm remain, which contain numerous bacterial cells and result in inaccurately low colony forming units (CFU). In addition, imaging of infected tissue ex vivo often results in a disparity between the CFU and the number of bacterial cells observed under the microscope. We hypothesized that this phenomenon is due to the biofilm extracellular polymeric substance decreasing the accessibility of stains and antibodies to the embedded bacterial cells. In this study, we describe incorporating EPS-degrading glycoside hydrolases for CFU determination to obtain a more accurate estimation of the viable cells and for immunohistochemistry to disrupt the biofilm matrix and increase primary antibody binding to the bacterial cells.
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影响因子：
3.7
作者：
Dalton T;Dowd SE;Wolcott RD;Sun Y;Watters C;Griswold JA;Rumbaugh KP
通讯作者：
Rumbaugh KP
DOI：
10.2174/1874285801105010021
发表时间：
2011
期刊：
The open microbiology journal
影响因子：
--
作者：
Craigen B;Dashiff A;Kadouri DE
通讯作者：
Kadouri DE
生物膜成熟度研究表明，锐性清创打开了一个随时间变化的治疗窗口
影响因子：
1.9
作者：
Wolcott, R. D.;Rumbaugh, K. P.;Dowd, S. E.
通讯作者：
Dowd, S. E.
影响因子：
3.1
作者：
Frank, Kristi L.;Guiton, Pascale S.;Dunny, Gary M.
通讯作者：
Dunny, Gary M.
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7.6
作者：
Izano, E. A.;Wang, H.;Kaplan, J. B.
通讯作者：
Kaplan, J. B.