Controlling long-range genomic interactions at a native locus by targeted tethering of a looping factor.
Controlling long-range genomic interactions at a native locus by targeted tethering of a looping factor.
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DOI：
10.1016/j.cell.2012.03.051
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发表时间：
2012-06-08
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Blobel GA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Deng W;Lee J;Wang H;Miller J;Reik A;Gregory PD;Dean A;Blobel GA
染色质环并置远端增强子和活性启动子，但它们的分子结构和与转录的关系尚不清楚。在红细胞中，基因座控制区（LCR）和β-珠蛋白启动子形成染色质环，需要转录因子GATA1和相关分子Ldb1。我们使用人造锌指（ZF）将Ldb1连接到β-珠蛋白启动子上，在GATA1缺失的红母细胞中，β-珠蛋白位点松弛且失活。值得注意的是，在没有GATA1的情况下，将Ldb1或仅将其自结合结构域靶向β-珠蛋白启动子可显著激活β-珠蛋白转录。启动子连接的Ldb1与LCR上的内源性Ldb1复合物相互作用，形成染色质环，引起RNA聚合酶II的募集和磷酸化。ZF-Ldb1蛋白在缺乏LCR的等位基因处无活性，表明其活性依赖于远距离相互作用。我们的研究结果证实Ldb1是gata1介导的环形成的关键效应因子，并表明染色质环形成是基因调控的因果基础。
Chromatin loops juxtapose distal enhancers with active promoters but their molecular architecture and relationship with transcription remain unclear. In erythroid cells, the locus control region (LCR) and β-globin promoter form a chromatin loop that requires transcription factor GATA1 and the associated molecule Ldb1. We employed artificial zinc fingers (ZF) to tether Ldb1 to the β-globin promoter in GATA1 null erythroblasts in which the β-globin locus is relaxed and inactive. Remarkably, targeting Ldb1 or only its self-association domain to the β-globin promoter substantially activated β-globin transcription in the absence of GATA1. Promoter-tethered Ldb1 interacted with endogenous Ldb1 complexes at the LCR to form a chromatin loop, causing recruitment and phosphorylation of RNA polymerase II. ZF-Ldb1 proteins were inactive at alleles lacking the LCR, demonstrating that their activities depend on long-range interactions. Our findings establish Ldb1 as critical effector of GATA1-mediated loop formation and indicate that chromatin looping causally underlies gene regulation.
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影响因子：
8
作者：
Cantor, AB;Orkin, SH
通讯作者：
Orkin, SH
影响因子：
56.9
作者：
Dekker, J;Rippe, K;Kleckner, N
通讯作者：
Kleckner, N
DOI：
10.1073/pnas.0902454106
发表时间：
2009-12-01
影响因子：
11.1
作者：
Nolis, Ilias K.;McKay, Daniel J.;Thanos, Dimitris
通讯作者：
Thanos, Dimitris
影响因子：
7
作者：
Cheng, Yong;Wu, Weisheng;Hardison, Ross C.
通讯作者：
Hardison, Ross C.
影响因子：
64.5
作者：
EVANS, T;FELSENFELD, G
通讯作者：
FELSENFELD, G