Characterization of the complete mitochondrial genome of Tripetaloceroides tonkinensis (Orthoptera: Tetrigoidea) from China and its phylogenetic analysis.
Characterization of the complete mitochondrial genome of Tripetaloceroides tonkinensis (Orthoptera: Tetrigoidea) from China and its phylogenetic analysis.
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中国山豆Tripetaloceroides tonkinensis（直翅目：Tetrigoidea）线粒体全基因组特征及其系统发育分析
DOI：
10.1080/23802359.2021.1938724
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发表时间：
2021-06-14
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Deng WA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang RJ;Xin L;Deng WA
对越南三瓣角蚱（Tripaloceroides tonkinensis）的线粒体基因组进行了序列测定和注释。完整的有丝分裂基因组长度为16，696 bp，由13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因、22个转运RNA基因和一个富含A + T的区域组成。13个PCG以典型的ATN密码子开始，以完全终止密码子结束（5个以TAG结束，8个以TAA结束）。总核苷酸组成为A 42.7%，G 10.34%，T 25.87%，C 21.08%。本研究构建的系统发育树证实了越南蚱与蚱总科其他种的亲缘关系较近，该研究有助于加深对蚱总科有丝分裂基因组的了解。
The mitochondrial genome (mitogenome) of theTripetaloceroides tonkinensis(Orthoptera: Tetrigoidea) was sequenced and annotated. The complete mitogenome has a length of 16,696 bp and consists of 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, 22 transfer RNA genes, and a A + T-rich region. Thirteen PCGs started with typical ATN codon and ended with complete stop codons (five with TAG, eight with TAA). The overall nucleotide composition was 42.7% of A, 10.34% of G, 25.87% of T, and 21.08% of C. The phylogenetic trees in the current study confirmed thatT.tonkinensiswas clustered with other Tetrigoidea species, and the study would improve our understanding for the mitogenomes of Tetrigoidea.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/bts199
发表时间：
2012-06-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Kearse M;Moir R;Wilson A;Stones-Havas S;Cheung M;Sturrock S;Buxton S;Cooper A;Markowitz S;Duran C;Thierer T;Ashton B;Meintjes P;Drummond A
通讯作者：
Drummond A
影响因子：
4.1
作者：
Bernt, Matthias;Donath, Alexander;Stadler, Peter F.
通讯作者：
Stadler, Peter F.
影响因子：
6.5
作者：
Ronquist F;Teslenko M;van der Mark P;Ayres DL;Darling A;Höhna S;Larget B;Liu L;Suchard MA;Huelsenbeck JP
通讯作者：
Huelsenbeck JP
影响因子：
64.8
作者：
ANDERSON, S;BANKIER, AT;YOUNG, IG
通讯作者：
YOUNG, IG