I-ApeI, a novel intron-encoded LAGLIDADG homing endonuclease from the archaeon, Aeropyrum pernix K1
I-ApeI, a novel intron-encoded LAGLIDADG homing endonuclease from the archaeon, Aeropyrum pernix K1
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I-ApeI，一种来自古细菌 Aeropyrum pernix K1 的新型内含子编码 LAGLIDADG 归巢核酸内切酶
作者：
N. Nomura;Yayoi Morinaga;N. Shirai;Y. Sako
古生代rRNA基因(RDNA)中有超过50个内含子被报道，其中一个子集嵌套了可能的归巢内切酶(Hease)基因。在这里，我们报道了一种新的古生菌LAGLIDADG型Hease，I-ApeKI[更正]，它由Pernix Aeropyrum K1的16S rDNA中的ApeK1.S908内含子编码。I-ApeKI[更正]由222个氨基酸组成，含有两个LAGLIDADG样序列。它识别20bp的非回文序列5‘-GCAAGGCTGAAAC向下箭头TTAAAGG，并切割目标DNA以产生突出的四核苷酸3’端。在裂解反应中，可以用Mn2+或Co2+替代Mg2+作为辅因子。在最小识别位点内的20个碱基中，有7个碱基是切割所必需的，它们位于切割位点的近端。
Over 50 introns have been reported in archaeal rRNA genes (rDNAs), a subset of which nests putative homing endonuclease (HEase) genes. Here, we report the identification and characterization of a novel archaeal LAGLIDADG-type HEase, I-ApeKI [corrected], encoded by the ApeK1.S908 intron within the 16S rDNA of Aeropyrum pernix K1. I-ApeKI [corrected] consists of 222 amino acids and harbors two LAGLIDADG-like sequences. It recognizes the 20 bp non-palindromic sequence 5'-GCAAGGCTGAAAC downward arrowTTAAAGG and cleaves target DNA to produce protruding tetranucleotide 3' ends. Either Mn2+ or Co2+ can be substituted for Mg2+ as a cofactor in the cleavage reaction. Of the 20 bases within the minimal recognition site, 7 are essential for cleavage and are located at positions proximal to the cleavage sites.
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影响因子：
5.6
作者：
Sussman, D;Chadsey, M;Seligman, LM
通讯作者：
Seligman, LM
单体归巢核酸内切酶 I-DmoI 的 LAGLIDADG 界面分析。
DOI：
10.1093/nar/gkh618
发表时间：
2004
期刊：
Nucleic acids research.
影响因子：
--
作者：
Silva,GeorgeH;Belfort,Marlene
通讯作者：
Belfort,Marlene
影响因子：
5.6
作者：
Chevalier, B;Turmel, M;Stoddard, BL
通讯作者：
Stoddard, BL
影响因子：
16
作者：
Jurica, NS;Monnat, RJ;Stoddard, BL
通讯作者：
Stoddard, BL
影响因子：
56.9
作者：
Rong, YS;Golic, KG
通讯作者：
Golic, KG