Insights from genomic profiling of transcription factors.
Insights from genomic profiling of transcription factors.
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DOI：
10.1038/nrg2636
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发表时间：
2009-09
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
基因调控领域的一个关键问题是转录因子结合的位置是否影响其有效性或其调节转录的机制。需要综合的转录因子结合图谱来解决这些问题，由于ChIP-chip和ChIP-Seq的技术进步，全基因组图谱现在已经成为可能。这篇综述讨论了如何最近的基因组分析的转录因子提供洞察如何实现结合特异性和染色质的功能影响转录因子与基因组相互作用的能力，并建议未来的实验，以进一步了解转录因子基因组相互作用的原因和后果。
A crucial question in the field of gene regulation is whether the location at which a transcription factor binds influences its effectiveness or the mechanism by which it regulates transcription. Comprehensive transcription factor binding maps are needed to address these issues, and genome-wide mapping is now possible thanks to the technological advances of ChIP-chip and ChIP-Seq. This review discusses how recent genomic profiling of transcription factors gives insight into how binding specificity is achieved and what features of chromatin influence the ability of transcription factors to interact with the genome, and also suggests future experiments to further our understanding of the causes and consequences of transcription factor-genome interactions.
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影响因子：
7
作者：
Bieda, M;Xu, XQ;Farnham, PJ
通讯作者：
Farnham, PJ
影响因子：
64.8
作者：
Heintzman, Nathaniel D.;Hon, Gary C.;Hawkins, R. David;Kheradpour, Pouya;Stark, Alexander;Harp, Lindsey F.;Ye, Zhen;Lee, Leonard K.;Stuart, Rhona K.;Ching, Christina W.;Ching, Keith A.;Antosiewicz-Bourget, Jessica E.;Liu, Hui;Zhang, Xinmin;Green, Roland D.;Lobanenkov, Victor V.;Stewart, Ron;Thomson, James A.;Crawford, Gregory E.;Kellis, Manolis;Ren, Bing
通讯作者：
Ren, Bing
DOI：
10.1126/science.1162327
发表时间：
2009-06-26
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Badis G;Berger MF;Philippakis AA;Talukder S;Gehrke AR;Jaeger SA;Chan ET;Metzler G;Vedenko A;Chen X;Kuznetsov H;Wang CF;Coburn D;Newburger DE;Morris Q;Hughes TR;Bulyk ML
通讯作者：
Bulyk ML
影响因子：
64.5
作者：
Cawley, S;Bekiranov, S;Gingeras, TR
通讯作者：
Gingeras, TR
影响因子：
64.5
作者：
Guenther, Matthew G.;Levine, Stuart S.;Young, Richard A.
通讯作者：
Young, Richard A.