Emerging Single-cell Approaches to Understand HIV in the Central Nervous System.

Emerging Single-cell Approaches to Understand HIV in the Central Nervous System.
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DOI:
10.1007/s11904-021-00586-7
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发表时间:
2022-03
影响因子:
4.6
通讯作者:
Farhadian SF
Farhadian SF
中科院分区:
医学2区
文献类型:
--
作者:
Corley MJ;Farhadian SF

文献摘要

参考文献

被引文献

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本综述重点介绍了与中枢神经系统 (CNS) 中 HIV 转化研究相关的新兴单细胞测序方法,总结了中枢神经系统中 HIV 有限的单细胞研究,并讨论了未来 HIV 转化中枢神经系统研究的机会。利用单细胞技术的创新方法以更高的分辨率和深度推进了基因组、蛋白质组、转录组和表观基因组的研究。对中枢神经系统组织(包括尸检大脑和脑脊液细胞)的单细胞分析可能有助于了解艾滋病毒感染者的中枢神经系统紊乱。新策略可以在单细胞水平上区分罕见感染细胞的不同分子特征,这表明有机会揭示中枢神经系统储存库中隐藏的艾滋病毒的分子特征。将多模式“组学”分析应用于艾滋病毒转化研究和血液以外的组织区室对于增进我们对病毒建立、持久性和根除的理解至关重要。
This review highlights emerging single-cell sequencing methods relevant to translational studies of HIV in the central nervous system (CNS), summarizes limited single-cell studies of HIV in the CNS, and discusses opportunities for future HIV translational CNS studies. Innovative methods utilizing single-cell technologies have advanced the study of genomes, proteomes, transcriptomes, and epigenomes at an enhanced resolution and depth. Single-cell analyses of central nervous system tissue, including autopsy brain and CSF cells, may shed light on CNS perturbations in people living with HIV. New strategies can distinguish distinct molecular identifies of rare infected cells at single-cell level, suggesting an opportunity to uncloak the molecular identity of hidden HIV in the CNS reservoir. Adoption of multimodal “omics” analyses to translational HIV studies and tissue compartments beyond blood will be critical to advancing our understanding of viral establishment, persistence, and eradication.
DOI: 10.1126/science.aau0730
发表时间: 2018-09-28
期刊: Science (New York, N.Y.)
影响因子: --
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Cao J;Cusanovich DA;Ramani V;Aghamirzaie D;Pliner HA;Hill AJ;Daza RM;McFaline-Figueroa JL;Packer JS;Christiansen L;Steemers FJ;Adey AC;Trapnell C;Shendure J
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发表时间: 2020-01-08
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Kessing, Cari F.;Spudich, Serena;Trautmann, Lydie
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