Xenbase: a Xenopus biology and genomics resource.
Xenbase: a Xenopus biology and genomics resource.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkm826
复制
发表时间：
2008-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Vize PD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bowes JB;Snyder KA;Segerdell E;Gibb R;Jarabek C;Noumen E;Pollet N;Vize PD
Xenbase（www.xenbase.org）是一个模式生物数据库，整合了关于青蛙、非洲爪蟾和热带爪蟾的各种生物学和基因组数据。从其他数据库、高通量筛选和科学文献中收集数据，并将其整合到一些涵盖社区、文献、基因和基因组分析等主题的数据库模块中。基因页由来自以下的数据自动组装：PizzGene、古尔登研究所、JGI、Metazome、MGI、OMIM、PubMed、Unigene、Zfin、商业供应商等。然后用内部注释补充这些数据。Xenbase已经实现了Gbrowse基因组浏览器，并提供了一个BLAST服务，允许用户专门搜索laevis或tropicalis的DNA或蛋白质目标。一个非洲爪蟾基因同义词表已经实施，并允许基因组，基因，出版物和高通量基因表达数据与其他非洲爪蟾数据和外部数据库资源无缝集成，使青蛙的发育和功能数据的财富提供给更广泛的研究界。
Xenbase (www.xenbase.org) is a model organism database integrating a diverse array of biological and genomic data on the frogs, Xenopus laevis and Xenopus (Silurana) tropicalis. Data is collected from other databases, high-throughput screens and the scientific literature and integrated into a number of database modules covering subjects such as community, literature, gene and genomic analysis. Gene pages are automatically assembled from data piped from the Entrez Gene, Gurdon Institute, JGI, Metazome, MGI, OMIM, PubMed, Unigene, Zfin, commercial suppliers and others. These data are then supplemented with in-house annotation. Xenbase has implemented the Gbrowse genome browser and also provides a BLAST service that allows users to specifically search either laevis or tropicalis DNA or protein targets. A table of Xenopus gene synonyms has been implemented and allows the genome, genes, publications and high-throughput gene expression data to be seamlessly integrated with other Xenopus data and to external database resources, making the wealth of developmental and functional data from the frog available to the broader research community.
登录
查看更多内容
影响因子：
7
作者：
Stein, LD;Mungall, C;Lewis, S
通讯作者：
Lewis, S
DOI：
10.1073/pnas.94.24.13017
发表时间：
1997-11-25
影响因子：
11.1
作者：
Kessler, DS
通讯作者：
Kessler, DS
影响因子：
14.9
作者：
Pollet, N;Schmidt, HA;Niehrs, C
通讯作者：
Niehrs, C
影响因子：
14.9
作者：
Maglott, Donna;Ostell, Jim;Pruitt, Kim D;Tatusova, Tatiana
通讯作者：
Tatusova, Tatiana
影响因子：
14.9
作者：
Blake JA;Eppig JT;Bult CJ;Kadin JA;Richardson JE;Mouse Genome Database Group
通讯作者：
Mouse Genome Database Group