Engineering the smallest transcription factor: accelerated evolution of a 63-amino acid peptide dual activator-repressor
Engineering the smallest transcription factor: accelerated evolution of a 63-amino acid peptide dual activator-repressor
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设计最小的转录因子：63 个氨基酸肽双激活子-阻遏物的加速进化
DOI：
10.1101/725739
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发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Brödel A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Brödel A
转录因子控制所有生命中的基因表达。这就提出了一个问题，即什么是能够支持这种活性的最小蛋白质。在自然界中，来自噬菌体λ的Cro是已知的最小的阻遏物（66个氨基酸; a.a.）但活化剂通常要大得多（例如λ cI，237 a.a.）。事实上，以前从Cro工程改造最小激活剂的努力在体内没有产生活性。在这项研究中，我们表明，定向进化的结果在一个新的Cro激活抑制因子，有效地发挥作用，λ cI，在体内。为了实现这一目标，我们开发了Phagemid辅助的持续进化：PACEmid。我们发现小至63-a.a.作为激活剂和/或阻遏物有效地起作用。据我们所知，这是迄今为止报道的最小的蛋白质基因调控因子，突出了转录因子从非常短的肽序列进化的能力。
Transcription factors control gene expression in all life. This raises the question of what is the smallest protein that can support such activity. In nature, Cro from bacteriophage λ is the smallest known repressor (66 amino acids; a.a.) but activators are typically much larger (e.g. λ cI, 237 a.a.). Indeed, previous efforts to engineer a minimal activator from Cro resulted in no activityin vivo. In this study, we show that directed evolution results in a new Cro activator-repressor that functions as efficiently as λ cI,in vivo. To achieve this, we develop Phagemid-Assisted Continuous Evolution: PACEmid. We find that a peptide as small as 63-a.a. functions efficiently as an activator and/or repressor. To our knowledge, this is the smallest protein gene regulator reported to date, highlighting the capacity of transcription factors to evolve from very short peptide sequences.
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通过合成 cro 基因的工程诱变改变了 Cro 阻遏蛋白。
DOI：
10.1073/pnas.82.4.1084
发表时间：
1985
影响因子：
11.1
作者：
Eisenbeis,SJ;Nasoff,MS;Noble,SA;Bracco,LP;Dodds,DR;Caruthers,MH
通讯作者：
Caruthers,MH
影响因子：
14.8
作者：
Carlson, Jacob C.;Badran, Ahmed H.;Guggiana-Nilo, Drago A.;Liu, David R.
通讯作者：
Liu, David R.
影响因子：
14.9
作者：
Allen JM;Simcha DM;Ericson NG;Alexander DL;Marquette JT;Van Biber BP;Troll CJ;Karchin R;Bielas JH;Loeb LA;Camps M
通讯作者：
Camps M
操纵子 DNA 片段与 lambda-cro 阻遏物的碱基序列特异性相互作用及其构象的变化。
影响因子：
11.4
作者：
S. J. Lee;M. Shirakawa;H. Akutsu;Y. Kyōgoku;M. Shiraishi;K. Kitano;M. Shin;E. Ohtsuka;M. Ikehara
通讯作者：
M. Ikehara
影响因子：
14.9
作者：
Babu, MM;Teichmann, SA
通讯作者：
Teichmann, SA