Molecular basis for the specific and multivariant recognitions of RNA substrates by human hnRNP A2/B1.
Molecular basis for the specific and multivariant recognitions of RNA substrates by human hnRNP A2/B1.
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人 hnRNP A2/B1 对 RNA 底物特异性和多变体识别的分子基础
DOI：
10.1038/s41467-017-02770-z
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发表时间：
2018-01-29
影响因子：
16.6
通讯作者：
Ma J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wu B;Su S;Patil DP;Liu H;Gan J;Jaffrey SR;Ma J
人hnRNP A2/B1是一种RNA结合蛋白，在许多生物学过程中发挥重要作用，包括mRNA的成熟、转运和代谢，以及长链非编码RNA的基因调控。据报道，hnRNPA 2/B1作为潜在的m6 A“阅读器”控制microRNA分选到外泌体并促进初级microRNA加工。hnRNP A2/B1包含两个RNA识别基序，其提供RNA底物的序列特异性识别。在这里，我们确定的晶体结构的串联RRM结构域的hnRNP A2/B1在复杂的各种RNA基板，阐明了特定的deletnitions的AGG和UAG图案的RRM 1和RRM 2域，分别。进一步的结构和生化结果表明，序列多样化的RNA底物的多变量结合模式，支持hnRNP A2/B1功能的RNA匹配机制。此外，结合生物信息学分析，我们的研究表明hnRNPA 2/B1可能通过“m6 A开关”机制介导m6 A的作用，而不是作为m6 A修饰的直接“阅读器”。
Human hnRNP A2/B1 is an RNA-binding protein that plays important roles in many biological processes, including maturation, transport, and metabolism of mRNA, and gene regulation of long noncoding RNAs. hnRNP A2/B1 was reported to control the microRNAs sorting to exosomes and promote primary microRNA processing as a potential m 6 A “reader.” hnRNP A2/B1 contains two RNA recognition motifs that provide sequence-specific recognition of RNA substrates. Here, we determine crystal structures of tandem RRM domains of hnRNP A2/B1 in complex with various RNA substrates, elucidating specific recognitions of AGG and UAG motifs by RRM1 and RRM2 domains, respectively. Further structural and biochemical results demonstrate multivariant binding modes for sequence-diversified RNA substrates, supporting a RNA matchmaker mechanism in hnRNP A2/B1 function. Moreover, our studies in combination with bioinformatic analysis suggest that hnRNP A2/B1 may mediate effects of m 6 A through a “m 6 A switch” mechanism, instead of acting as a direct “reader” of m 6 A modification.
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n（6） - 甲基腺苷依赖性RNA结构开关调节RNA蛋白质相互作用。
影响因子：
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作者：
Liu, Nian;Dai, Qing;Zheng, Guanqun;He, Chuan;Parisien, Marc;Pan, Tao
通讯作者：
Pan, Tao
影响因子：
48
作者：
Linder, Bastian;Grozhik, Anya V.;Olarerin-George, Anthony O.;Meydan, Cem;Mason, Christopher E.;Jaffrey, Samie R.
通讯作者：
Jaffrey, Samie R.
DOI：
10.1042/bcj20160499
发表时间：
2017-04-07
期刊：
The Biochemical journal
影响因子：
--
作者：
Harrison AF;Shorter J
通讯作者：
Shorter J
影响因子：
2.7
作者：
Barraud, Pierre;Allain, Frederic H. -T.
通讯作者：
Allain, Frederic H. -T.
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作者：
Cook KB;Kazan H;Zuberi K;Morris Q;Hughes TR
通讯作者：
Hughes TR