Agent-based models in translational systems biology.
Agent-based models in translational systems biology.
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DOI：
10.1002/wsbm.45
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发表时间：
2009-09
影响因子：
7.9
通讯作者：
Vodovotz, Yoram
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
An, Gary;Mi, Qi;Dutta-Moscato, Joyeeta;Vodovotz, Yoram
需要有效的知识表示方法，以便在应对影响当今世界的一系列疾病方面取得进展。这些疾病由它们的机械复杂性、冗余性和非线性来定义。翻译系统生物学的目标是利用计算模拟的力量来简化药物/设备设计，模拟临床试验，并最终预测药物对个体的影响。基于智能体的建模能够涵盖多个尺度的生物过程和空间考虑，再加上直观的建模范例，表明该建模框架非常适合于翻译系统生物学。这篇综述描述了基于代理的建模，并给出了它在急性炎症和伤口愈合方面的翻译应用的例子。
Effective translational methodologies for knowledge representation are needed in order to make strides against the constellation of diseases that affect the world today. These diseases are defined by their mechanistic complexity, redundancy, and nonlinearity. Translational systems biology aims to harness the power of computational simulation to streamline drug/device design, simulate clinical trials, and eventually to predict the effects of drugs on individuals. The ability of agent-based modeling to encompass multiple scales of biological process as well as spatial considerations, coupled with an intuitive modeling paradigm, suggests that this modeling framework is well suited for translational systems biology. This review describes agent-based modeling and gives examples of its translational applications in the context of acute inflammation and wound healing.
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DOI：
10.1073/pnas.072081299
发表时间：
2002-05-14
影响因子：
11.1
作者：
Bankes, SC
通讯作者：
Bankes, SC
影响因子：
8.5
作者：
Deisboeck, TS;Berens, ME;Chiocca, EA
通讯作者：
Chiocca, EA
影响因子：
1.4
作者：
An, Gary;Faeder, James;Vodovotz, Yoram
通讯作者：
Vodovotz, Yoram
影响因子：
--
作者：
Folcik, Virginia A.;An, Gary C.;Orosz, Charles G.
通讯作者：
Orosz, Charles G.
影响因子：
--
作者：
Engelberg JA;Ropella GE;Hunt CA
通讯作者：
Hunt CA