Genome report: chromosome-level draft assemblies of the snow leopard, African leopard, and tiger (Panthera uncia, Panthera pardus pardus, and Panthera tigris).
Genome report: chromosome-level draft assemblies of the snow leopard, African leopard, and tiger (Panthera uncia, Panthera pardus pardus, and Panthera tigris).
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DOI：
10.1093/g3journal/jkac277
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发表时间：
2022-12-01
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大型猫科动物（Panthera属）是地球上最受欢迎和最有魅力的物种之一。虽然有一些参考基因组可用于该分支，但很少有染色体水平的参考基因组，这抑制了高分辨率的基因组研究。在染色体或近染色体水平上对虎（Panthera tigris）、雪豹（Panthera uncia）和非洲豹（Panthera pardus pardus） 3个物种的基因组进行了组装。我们结合使用了短读和长读技术，以及来自Hi-C技术的近距离结扎数据，以实现每个个体的高连续性和连续性。我们希望这些基因组将有助于进一步研究这一标志性哺乳动物群体的进化和保护。
The big cats (genus Panthera) represent some of the most popular and charismatic species on the planet. Although some reference genomes are available for this clade, few are at the chromosome level, inhibiting high-resolution genomic studies. We assembled genomes from 3 members of the genus, the tiger (Panthera tigris), the snow leopard (Panthera uncia), and the African leopard (Panthera pardus pardus), at chromosome or near-chromosome level. We used a combination of short- and long-read technologies, as well as proximity ligation data from Hi-C technology, to achieve high continuity and contiguity for each individual. We hope that these genomes will aid in further evolutionary and conservation research of this iconic group of mammals.
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